1. 概述
在传统数据库(如:MYSQL)中,JOIN操作是非常常见且非常耗时的。而在HADOOP中进行JOIN操作,同样常见且耗时,由于Hadoop的独特设计思想,当进行JOIN操作时,有一些特殊的技巧。
本文首先介绍了Hadoop上通常的JOIN实现方法,然后给出了几种针对不同输入数据集的优化方法。
2. 常见的join方法介绍
假设要进行join的数据分别来自File1和File2.
2.1 reduce side join
reduce side join是一种最简单的join方式,其主要思想如下:
在map阶段,map函数同时读取两个文件File1和File2,为了区分两种来源的key/value数据对,对每条数据打一个标签(tag),比如:tag=0表示来自文件File1,tag=2表示来自文件File2。即:map阶段的主要任务是对不同文件中的数据打标签。
在reduce阶段,reduce函数获取key相同的来自File1和File2文件的value list, 然后对于同一个key,对File1和File2中的数据进行join(笛卡尔乘积)。即:reduce阶段进行实际的连接操作。
2.2 map side join
之所以存在reduce side join,是因为在map阶段不能获取所有需要的join字段,即:同一个key对应的字段可能位于不同map中。Reduce side join是非常低效的,因为shuffle阶段要进行大量的数据传输。
Map side join是针对以下场景进行的优化:两个待连接表中,有一个表非常大,而另一个表非常小,以至于小表可以直接存放到内存中。这样,我们可以将小表复制多份,让每个map task内存中存在一份(比如存放到hash table中),然后只扫描大表:对于大表中的每一条记录key/value,在hash table中查找是否有相同的key的记录,如果有,则连接后输出即可。
为了支持文件的复制,Hadoop提供了一个类DistributedCache,使用该类的方法如下:
(1)用户使用静态方法DistributedCache.addCacheFile()指定要复制的文件,它的参数是文件的URI(如果是HDFS上的文件,可以这样:hdfs://namenode:9000/home/XXX/file,其中9000是自己配置的NameNode端口号)。JobTracker在作业启动之前会获取这个URI列表,并将相应的文件拷贝到各个TaskTracker的本地磁盘上。(2)用户使用DistributedCache.getLocalCacheFiles()方法获取文件目录,并使用标准的文件读写API读取相应的文件。
2.3 SemiJoin
SemiJoin,也叫半连接,是从分布式数据库中借鉴过来的方法。它的产生动机是:对于reduce side join,跨机器的数据传输量非常大,这成了join操作的一个瓶颈,如果能够在map端过滤掉不会参加join操作的数据,则可以大大节省网络IO。
实现方法很简单:选取一个小表,假设是File1,将其参与join的key抽取出来,保存到文件File3中,File3文件一般很小,可以放到内存中。在map阶段,使用DistributedCache将File3复制到各个TaskTracker上,然后将File2中不在File3中的key对应的记录过滤掉,剩下的reduce阶段的工作与reduce side join相同。
更多关于半连接的介绍,可参考:半连接介绍:http://wenku.baidu.com/view/ae7442db7f1922791688e877.html
2.4 reduce side join + BloomFilter
在某些情况下,SemiJoin抽取出来的小表的key集合在内存中仍然存放不下,这时候可以使用BloomFiler以节省空间。
BloomFilter最常见的作用是:判断某个元素是否在一个集合里面。它最重要的两个方法是:add() 和contains()。最大的特点是不会存在false negative,即:如果contains()返回false,则该元素一定不在集合中,但会存在一定的true negative,即:如果contains()返回true,则该元素一定可能在集合中。
因而可将小表中的key保存到BloomFilter中,在map阶段过滤大表,可能有一些不在小表中的记录没有过滤掉(但是在小表中的记录一定不会过滤掉),这没关系,只不过增加了少量的网络IO而已。
更多关于BloomFilter的介绍,可参考:http://blog.csdn.net/jiaomeng/article/details/1495500
3. 二次排序
在Hadoop中,默认情况下是按照key进行排序,如果要按照value进行排序怎么办?即:对于同一个key,reduce函数接收到的value list是按照value排序的。这种应用需求在join操作中很常见,比如,希望相同的key中,小表对应的value排在前面。
有两种方法进行二次排序,分别为:buffer and in memory sort和 value-to-key conversion。
对于buffer and in memory sort,主要思想是:在reduce()函数中,将某个key对应的所有value保存下来,然后进行排序。 这种方法最大的缺点是:可能会造成out of memory。
对于value-to-key conversion,主要思想是:将key和部分value拼接成一个组合key(实现WritableComparable接口或者调用setSortComparatorClass函数),这样reduce获取的结果便是先按key排序,后按value排序的结果,需要注意的是,用户需要自己实现Paritioner,以便只按照key进行数据划分。Hadoop显式的支持二次排序,在Configuration类中有个setGroupingComparatorClass()方法,可用于设置排序group的key值,具体参考:http://www.cnblogs.com/xuxm2007/archive/2011/09/03/2165805.html
4. 后记
最近一直在找工作,由于简历上写了熟悉Hadoop,所以几乎每个面试官都会问一些Hadoop相关的东西,而 Hadoop上Join的实现就成了一道必问的问题,而极个别公司还会涉及到DistributedCache原理以及怎样利用DistributedCache进行Join操作。为了更好地应对这些面试官,特整理此文章。
5. 参考资料
(1) 书籍《Data-Intensive Text Processing with MapReduce》 page 60~67 Jimmy Lin and Chris Dyer,University of Maryland, College Park
(2) 书籍《Hadoop In Action》page 107~131
(3) mapreduce的二次排序 SecondarySort:http://www.cnblogs.com/xuxm2007/archive/2011/09/03/2165805.html
(4) 半连接介绍:http://wenku.baidu.com/view/ae7442db7f1922791688e877.html
(5) BloomFilter介绍:http://blog.csdn.net/jiaomeng/article/details/1495500
(6)本文来自:http://dongxicheng.org/mapreduce/hadoop-join-two-tables/
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看完了上面的 hadoop 中 MR 常规 join 思路,下面我们来看一种比较极端的例子,大表 join 小表,而小表的大小在10M以下的情况:
之所以我这里说小表要限制10M以下,是因为我这里用到的思路是 :
file-》jar-》main String configuration -》configuration map HashMap
步骤:
1、从jar里面读取的文件内容以String的形式存在main方法的 configuration context 全局环境变量里
2、在map函数里读取 context 环境变量的字符串,然后split字符串组建小表成为一个HashMap
这样一个大表关联小表的例子就ok了,由于context是放在namenode上的,而namenode对内存是有限制的,
所以你的小表文件不要太大,这样我们可以比较的方便的利用 context 做join了。
这种方式其实就是 2.2 map side join 的一种具体实现而已。
Talk is cheap, show you the code~
003 | public static class MapperClass extends |
004 | Mapper<LongWritable, Text, Text, Text> { |
006 | Configuration config = null ; |
007 | HashSet<String> idSet = new HashSet<String>(); |
008 | HashMap<String, String> cityIdNameMap = new HashMap<String, String>(); |
009 | Map<String, String> houseTypeMap = new HashMap<String, String>(); |
011 | public void setup(Context context) { |
012 | config = context.getConfiguration(); |
015 | String idStr = config.get( "idStr" ); |
016 | String[] idArr = idStr.split( "," ); |
017 | for (String id : idArr) { |
021 | String cityIdNameStr = config.get( "cityIdNameStr" ); |
022 | String[] cityIdNameArr = cityIdNameStr.split( "," ); |
023 | for (String cityIdName : cityIdNameArr) { |
024 | cityIdNameMap.put(cityIdName.split( "\t" )[ 0 ], |
025 | cityIdName.split( "\t" )[ 1 ]); |
028 | houseTypeMap.put( "8" , "Test" ); |
032 | public void map(LongWritable key, Text value, Context context) |
033 | throws IOException, InterruptedException { |
035 | String[] info = value.toString().split( "\\|" ); |
036 | String insertDate = info[InfoField.InsertDate].split( " " )[ 0 ] |
038 | insertDate = insertDate |
039 | + info[InfoField.InsertDate].split( " " )[ 0 ].split( "-" )[ 1 ]; |
041 | String userID = info[InfoField.UserID]; |
042 | if (!idSet.contains(userID)) { |
046 | String disLocalID = "" ; |
047 | String[] disLocalIDArr = info[InfoField.DisLocalID].split( "," ); |
048 | if (disLocalIDArr.length >= 2 ) { |
049 | disLocalID = disLocalIDArr[ 1 ]; |
052 | disLocalID = disLocalIDArr[ 0 ]; |
053 | } catch (Exception e) { |
058 | String localValue = cityIdNameMap.get(disLocalID); |
059 | disLocalID = localValue == null ? disLocalID : localValue; |
061 | String[] cateIdArr = info[InfoField.CateID].split( "," ); |
063 | String secondType = "" ; |
064 | if (cateIdArr.length >= 3 ) { |
065 | cateId = cateIdArr[ 2 ]; |
066 | if (houseTypeMap.get(cateId) != null ) { |
067 | secondType = houseTypeMap.get(cateId); |
075 | String upType = info[InfoField.UpType]; |
076 | String outKey = insertDate + "_" + userID + "_" + disLocalID + "_" |
078 | String outValue = upType.equals( "0" ) ? "1_1" : "1_0" ; |
079 | context.write( new Text(outKey), new Text(outValue)); |
083 | public static class ReducerClass extends |
084 | Reducer<Text, Text, NullWritable, Text> { |
086 | public void reduce(Text key, Iterable<Text> values, Context context) |
087 | throws IOException, InterruptedException { |
091 | for (Text val : values) { |
092 | String[] tmpArr = val.toString().split( "_" ); |
093 | pv += Integer.parseInt(tmpArr[ 0 ]); |
094 | uv += Integer.parseInt(tmpArr[ 1 ]); |
097 | String outValue = key + "_" + pv + "_" + uv; |
098 | context.write(NullWritable.get(), new Text(outValue)); |
103 | public String getResource(String fileFullName) throws IOException { |
105 | InputStream is = this .getClass().getResourceAsStream(fileFullName); |
106 | BufferedReader br = new BufferedReader( new InputStreamReader(is)); |
109 | while ((s = br.readLine()) != null ) |
110 | res = res.equals( "" ) ? s : res + "," + s; |
114 | public static void main(String[] args) throws IOException, |
115 | InterruptedException, ClassNotFoundException { |
116 | Configuration conf = new Configuration(); |
117 | String[] otherArgs = new GenericOptionsParser(conf, args) |
119 | if (otherArgs.length != 2 ) { |
123 | String idStr = new Test().getResource( "userIDList.txt" ); |
124 | String cityIdNameStr = new Test().getResource( "cityIdName.txt" ); |
125 | conf.set( "idStr" , idStr); |
126 | conf.set( "cityIdNameStr" , cityIdNameStr); |
127 | Job job = new Job(conf, "test01" ); |
129 | job.setJarByClass(Test. class ); |
130 | job.setMapperClass(Test.MapperClass. class ); |
131 | job.setReducerClass(Test.ReducerClass. class ); |
132 | job.setNumReduceTasks( 25 ); |
133 | job.setOutputKeyClass(Text. class ); |
134 | job.setOutputValueClass(Text. class ); |
135 | job.setMapOutputKeyClass(Text. class ); |
136 | job.setMapOutputValueClass(Text. class ); |
138 | FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(otherArgs[ 0 ])); |
139 | org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat.setOutputPath( |
140 | job, new Path(otherArgs[ 1 ])); |
142 | System.exit(job.waitForCompletion( true ) ? 0 : 1 ); |
说明:
1、getResource() 方法指定了可以从jar包中读取配置文件,并拼接成一个String返回。
2、setup() 方法起到一个mapreduce前的初始化的工作,他的作用是从 context 中
获取main中存入的配置文件字符串,并用来构建一个hashmap,放在map外面,
每个node上MR前只被执行一次。
推荐阅读:
使用HBase的MAP侧联接
http://blog.sina.com.cn/s/blog_ae33b83901016lkq.html
PS:关于如何从jar包中读取配置文件,请参考:
(1)深入jar包:从jar包中读取资源文件 http://www.iteye.com/topic/483115
(2)读取jar内资源文件 http://heipark.iteye.com/blog/1439114