文献解读：HOXA家族成员在喉鳞状细胞癌中的表达谱及预后价值

今天跟大家分享的是2020年3月发表在Front Oncol（IF：4.848）杂志上的一篇文章Expression Profile and Prognostic Values of HOXA Family Members in Laryngeal Squamous Cell Cancer.在文章中作者基于TCGA数据库和综合的生物信息学分析，评估了HOXA家族成员的表达谱和预后价值。

 

Expression Profile and Prognostic Values of HOXA Family Members in Laryngeal Squamous Cell Cancer

 

HOXA家族成员在喉鳞状细胞癌中的表达谱及预后价值

 

一.研究背景

包含11个成员的HOXA gene family广泛参与人类癌症的生物学功能。但是，目前少有关于HOXA基因在喉鳞状细胞癌（LSCC）中的表达谱和预后价值的研究。因此，作者基于TCGA数据库和综合的生物信息学分析，评估了HOXA家族成员的表达谱和预后价值。

二.分析流程

 

三.结果解读

1.HOXA成员在LSCC组织中的表达情况

首先作者使用Perl软件处理了来自TCGA的111个LSCC样品和12个正常对照样品的HOXA成员（HOXA 1 – 13）的mRNA表达数据。

然后用corrplot包计算了HOXA家族基因的Pearson相关性，来评估了这些基因的相关性。从结果可以发现，HOXA家族基因间呈现显著的相关性（图1）。

 

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