nnUNet源码解读（二）：nnUNet数据预处理crop方法

最新推荐文章于 2024-11-03 06:26:00 发布
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【深度学习】深入浅出nnUnet的数据处理方法
李响
06-14 5282
【深度学习】深入浅出nnUnet的数据处理方法 文章目录 1 nnUNet数据预处理crop方法 2 预测结果可视化 3 如何针对三维医学图像分割任务进行通用数据预处理：nnUNet中预处理流程总结 3.1 数据格式转换 3.2 图像裁剪Crop 3.3 重采样Resample 3.4 标准化Normalization 4 后处理 1 nnUNet数据预处理crop方法 plan_and_preprocess 运行分割，首先需要对数据集进行数据预处理，这也是nnUNet的精髓所在。 nnUNet_
Tensorflow 2.x(keras)源码详解之第五章：数据预处理
weixin_43178406的博客
04-21 1万+
 本文主要介绍了Tensorflow 2.x(keras)源码详解之第五章：数据预处理，希望能对学习TensorFlow 2的同学有所帮助。 文章目录 1. 数据预处理流程 2. 实战代码
图片、numpy放大的插值方法
weixin_43215738的博客
10-11 8909
当新numpy/图像比原numpy/图像更大时，插值方法： 0？原数组值？线性插值？ 1.numpy 形式一： a.resize(new_shape) #输入 import numpy as np # Making a random array gfg = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6]) # Required values 12, existing values 6 gfg.resize(3, 4) print(gfg) #输出： [[1 2 3 4] [5 6
Unet网络架构讲解
最新发布
weixin_40641178的博客
11-03 2350
预处理是怎么实现的_nnUNet学习笔记-预处理-crop
weixin_39594103的博客
01-12 907
U-Net是医学图像分割中最经典的分割网络，目前(2020.04.03)已经有过万的引用。过去的这5年里，针对提升U-Net有非常多的工作，但对于U-Net本身，不同的人实现出来性能大概率不一样，Fabian组开发的这个U-Net实现，是目前笔者看到性能最好的，但同时这个代码每一部分都做了精细的优化：预处理，数据增广，后处理，集成等等，不同模块之间耦合程度较高，因此想要把自己的一些想法加入到这个框...
nnUNet代码学习——数据预处理部分（一）
weixin_41962493的博客
08-31 7640
nnUNet最大的优点，就是可以根据数据集的情况，自适应的选择模型情况，而这一切的基础建立在nnUNet具有一套自成体系的数据分析框架，下面就开始一步一步解析nnUNet数据分析代码。相关代码存在于 nnUNet_plan_and_preprocess.py文件中。 参数解析 该文件首先就是参数配置，包括 task_id, planner3d, planner2d, no_pp, tl, tf, verify_dataset_integrity, overwrite_plans, overwrite_pl
nnUNetv2训练流程——环境配置、数据集构建、数据处理、训练
weixin_45882172的博客
04-26 5989
nnUNetv2初使用，分享内容包括：环境配置、数据集文件构建、数据格式化、数据预处理、数据训练整体流程说明。
（二：2020.07.08）nnUNet方法解析（7.31更新认识）
Jojo论文基地
07-08 1万+
医学图像深度学习分割方法的自动设计（二）（nnUNet /2020.04）《Automated Design of Deep Learning Methods for Biomedical Image Segmentation》 1.本文是对该论文涉及的Methods进行解读和理解，参考上一篇的解读论文主体解读 2.红色是理解困难部分，正在进行结合附录、第一版nnunet论文、源码进行理解 3.绿色是提到附录的部分 4.橙色是本文关键字 5.蓝色是抛出的问题 Methods (该部分提到的设计规则可以在附
PyTorch学习笔记（二）图像数据预处理
12-21
这些预处理方法通常包括数据增强和标准化，目的是使模型在训练过程中接触到更多多样化的图像样本，从而更好地适应实际场景。 在PyTorch的`torchvision.transforms`模块中，提供了许多基本的图像变换类，如填充(Pad)...
nnU-Net
qinxin_ni的博客
12-29 5089
原文连接：https://arxiv.org/abs/1904.08128 原文开源代码：https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet Q1：2D U-Net？ A1: U-net 网络_qinxin_ni的博客-CSDN博客 (1) 使用全卷积神经网络。(全卷积神经网络就是卷积取代了全连接层，全连接层必须固定图像大小而卷积不用，所以这个策略使得，你可以输入任意尺寸的图片，而且输出也是图片，所以这是一个端到端的网络。)    (2) 左边的网络是收缩路径...
nnUNet基础分割网络框架
weixin_41962493的博客
10-12 2902
在分析完nnUNet的基础训练框架之后，再接着分析一下nnUNet的基础分割网络，2D，3D的分割网络都是在此基础上进行构建的。此部分的代码在nnunet/network_architecture/neural_network.py中。 #基础的神经网络框架 class NeuralNetwork(nn.Module): def __init__(self): super(NeuralNetwork, self).__init__() def get_device(se
Python-nnUNet是一个专为医学图像分割而设计的框架
08-11
nnU-Net是一个专为医学图像分割而设计的框架。 给定一个新的数据集（包括训练案例），nnU-Net将自动处理整个实验管道。
nnunetv2网络结构详解
lzworld的博客
06-21 1850
nnunetv2的网络结构和loss
[问题解决] nnUNet 无法绘制网络结构图的问题
W1a2b3D的博客
12-17 579
nnUnet的时候报错无法绘制结构图的解决方案
unet 网络结构
qq_40107571的博客
10-03 1万+
unet 网络结构
神经网络（四）：UNet图像分割网络
悟兰因的博客
09-25 5794
UNet网络是一种用于图像分割的卷积神经网络，其特点是采用了U型网络结构，因此称为UNet。编码器：逐步提取输入图像的特征并降低空间分辨率。解码器：通过上采样操作将特征图恢复到原始输入图像的尺寸，并逐步生成分割结果。【CNN角度的编码器、解码器】以卷积神经网络为例，输入为一个猫，进行特征提取后输出图片类别。编码器：完成对输入图片中猫的特征提取。解码器：将特征提取的结果解码为分类结果。【RNN角度的编码器、解码器】以循环神经网络LSTM为例，输入为一个文本，进行特征提取再输出。
Unet网络架构讲解（从零到一，逐行编写并重点讲解数据维度变化）
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Unet网络架构从零到一复现
nnUnet 网络博客汇总---方便大家学习
u013313168的专栏
03-18 2199
（一：2020.07.06）nnUNet论文主体解析（8.02更新认识） （二：2020.07.08）nnUNet方法解析（7.31更新认识） （三：2020.07.10）nnUNet附录解析（7.31更新认识） （四：2020.07.28）nnUNet最舒服的训练教程（让我的奶奶也会用nnUNet（上））（11.05更新） （五：2020.07.31）nnUNet最简单的推理教程（让我的奶奶也会用nnUNet（下）） （十七：2020.09.10）nnUNet最全问题收录（9.10更新） （三十八：20.
（一：2020.07.06）nnUNet论文主体解析（8.02更新认识）
Jojo论文基地
07-06 1万+
医学图像深度学习分割方法的自动设计（nnUNet）摘要论文内容1.介绍2.结果1.nnUNet可以自动适应任何新的数据2.nnUNet极佳地掌握了目标标签的结构和数据图片的属性3.nnUNet在多个不同任务中的表现，都要比一些刻意设计的“管道”要好4.“管道”配置对结果的影响要比网络结构变化对结果的影响大5.不同的数据集需要不同“管道”配置6.多任务提升了决策（方案）的鲁棒性功能快捷键合理的创建标题，有助于目录的生成如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定
数据预处理：对图像进行预处理，例如缩放、裁剪、正则化等。
06-07
数据预处理是深度学习中非常重要的一步，可以提高模型的鲁棒性和泛化能力。在对图像进行预处理时，可以采取以下一些常用的方法： 1. 缩放：将图像的大小缩放到固定的尺寸，以便于模型的输入。通常情况下，你需要将所有的训练图像缩放到相同的大小，例如224x224或者300x300。 2. 裁剪：对图像进行裁剪，以减少冗余的背景信息，突出图像中的主要内容。例如，你可以对鱼类图像进行裁剪，使其只包含鱼的部分。 3. 翻转和旋转：改变图像的方向和角度，以增加数据集的多样性。例如，你可以随机翻转和旋转鱼类图像，以使模型更加鲁棒。 4. 正则化：对图像进行像素值的归一化，以便于模型的训练。通常情况下，你需要将像素值缩放到0到1之间，或者使用标准化方法进行归一化。 在使用Cube AI框架进行数据预处理时，你可以使用Cube Vision库中的一些函数来实现这些预处理方法。例如，你可以使用`cv::resize`函数来缩放图像，使用`cv::crop`函数来裁剪图像，使用`cv::flip`函数来翻转图像。需要注意的是，在预处理图像时，你需要保持训练集和验证集的一致性，以确保模型的准确率和泛化能力。
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