经典算法——最长公共子序列

最长公共子序列问题-LCS问题

问题描述：

给定两个序列 X={x1,x2,x3,…,xm}和Y={y1,y2,…,yn}，求X和Y长度最长的公共子序列。

求解思路：

1. 寻找特征:
   LCS问题具有最优子结构性质。可以将子问题对应两个输入序列的前缀对。
   令Z = {z1,z2,…,zk}，为X和Y的任意LCS。有如下性质，
   1.1 如果xm = yn,则zk = xm = yn 且Zk-1是Xm-1和Yn-1的一个LCS。
   1.2 如果xm不等于yn，那么zk不等于xm意味着Z是Xm-1和Y的一个LCS。
   1.3 如果xm不等于yn，那么zk不等于yn意味着Z是Xm和Yn-1的一个LCS。

2. 设计递归公式
   根据上面的特征，可以知道要求解Xn和Ym的一个LCS时，我们需要求解一个或两个子问题。如果xm=yn，我们应该求解Xm-1和Yn-1的一个LCS。如果xm不等于yn，就必须求解两个子问题：求Xm-1和Y的一个LCS与X和Yn-1的一个LCS。其中较长的一个即为X和Y的一个LCS。
   可以用一个二维数组C来储存Xi和Yi的LCS长度，可以得到如下公式：
   

3. 优化
   这里对与这个问题可以使用动态数组的方法，将C[i,j]自底向上的计算出来，最终求得C[m,n],也就是Xm和Yn的最大公共子序列。但是通过观察上面那个公式，我们可以发现要计算C[i, j]只需计算C[i-1,j-1]或者C[i-1,j]和C[i,j-1]。而无需用到C[i,0]～C[i,j-1]及C[i-1,j]～C[i-1,n]。
   所以我们可以采用自顶而下的方法，需要用到哪个再去计算那个，这样可以减小计算量。也被称作为备忘录方法

4. 算法描述
   首先将C[i,0],C[0,j]初始化为0。其余m×n个C[i,j]全部初始化为-1。
   计算C[i,j]的递归算法LCS(X,Y, i,j,C)：
   若x[i]=y[j]，则去检查C[i-1,j-1]，若C[i-1,j-1]> -1（已经计算出来），就直接把C[i-1,j-1]+1赋给C[i,j]。若C[i-1,j-1]=-1（尚未计算出来），就递归调用LCS(X,Y, i-1,j-1,C) 计算出C[i-1,j-1]，然后再把C[i-1,j-1]+1赋给C[i,j] 。
   若x[i] != y[j]，则要检查C[i-1,j]和C[i,j-1]。若两者均 > -1（已经计算出来），
   则把max{ C[i-1,j], C[i,j-1]} 赋给C[i,j]。若C[i-1,j], C[i,j-1] 两者中有一个等于-1（尚未计算出来），或两者均等于-1，就递归调用LCS将其计算出来，
   然后再把max{ C[i-1,j], C[i,j-1]} 赋给C[i,j]。

5. 实现代码

#include <iostream>
#include <stdio.h>
#include <string.h>
using namespace std;

#define max(a,b) ((a) > (b))? (a): (b)

//备忘录方法
int LCS(char X[], char Y[], int i, int j, int **C ) 
{

    if (X[i] == Y[j])
    {
        if (C[i-1][j-1] == -1)
        {
            LCS(X, Y, i-1, j-1, C); 
        } 

        C[i][j] = C[i-1][j-1] + 1;

    } else {
        if (C[i-1][j] == -1)
        {
            LCS(X, Y, i-1, j, C);
        } 

        if (C[i][j-1] == -1)
        {
            LCS(X, Y, i, j-1, C);
        }

        C[i][j] = max(C[i-1][j], C[i][j-1]);
    }
    return 0;
}

int main()
{
    string X = "ABCBDAB";
    string Y = "BDCABA";
    int X_size = X.size();
    int Y_size = Y.size();
    char *Xarray = new char(X_size+1);
    char *Yarray = new char(Y_size+1);
    Xarray[0] = '#';
    Yarray[0] = '#';
    //将字符串转换成数组
    for (int i=0; i < X_size; i++)
    {
        Xarray[i+1] = X[i];
    }
//  ++Xarray = '\0';
    for (int i=0; i < Y_size; i++)
    {
        Yarray[i+1] = Y[i];
    }
//  ++Yarray = '\0';


    //创建动态二维数组，用来存放LCS的长度
    int **C;
    C = new int* [X_size+1];
    for(int i = 0; i <= X_size+1; i++)
    {
        C[i]=new int[Y_size+1];
        memset(C[i], -1, sizeof(int)*(Y_size+1));
    }

    for (int i = 0; i <= X_size+1; i++)
    {
        C[i][0] = 0;
    }

    for (int j = 0; j <= Y_size+1; j++)
    {
        C[0][j] = 0;
    }

    LCS(Xarray, Yarray, X_size, Y_size, C);
    cout << C[X_size][Y_size] << endl;

    return 0;
}

---

遇到问题

1. 创建动态数组

//创建动态二维数组，用来存放LCS的长度
    int **C;
    C = new int* [X_size+1];
    for(int i = 0; i <= X_size+1; i++)
    {
        C[i]=new int[Y_size+1];
        //生成的同时初始化
        memset(C[i], -1, sizeof(int)*(Y_size+1)); 
    }

1. 要转换字符串，使下标从1开始