R -- 3 Installing R Packages

https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/
下载Rtool软件
在RStudio中find.package(“devtools”)，如果没有，install.package(“devtools”), library(devtools), find_rtools()如果结果为true，则Rtools安装正确。

一般的R packages 都在CRAN，有些生医工相关的package在Bioconductor Project。

a <- available.packages() ##查看一些package的相关信息
head(rownames(a),3) ## Show the names of the first few packages

会显示：

## [1] "A3" "abc" "abcdeFBA"

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install.packages("slidify") ##install slidify package from CRAN
install.packages(c("slidify","ggplot2","devtools"))##同时安装几个包

或者在Rstutio里面选择tool->install package

source("http://bioconductor.org/bioLite.R")
biocLite() ##get basic installer and basic set of R packages
bioLite(c("GenomicFeatures","AnnotationDbi")) ##同时安装几个包

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library(ggplot2) ##load package,不要写双引号
search() ##显示package里的函数