20. Lammps命令学习-初始化部分总结

来源： “码农不会写诗”公众号
链接：Lammps命令学习-初始化部分总结

Initialization

  设置在创建原子或从文件中读取原子之前需要定义的参数，主要涉及包括echo style，dimension N，boundary x y z，units style，atom_style style args等命令

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01 初始化命令回顾

• echo style：在读取和处理输入脚本中每条命令时将其回显到屏幕或日志文件
• boundary x y z：设置全局模拟框的边界条件
• dimension N：设置模拟的维度
• units style：设置模拟的单位类型
• atom_style style args：设置模拟的原子类型

02 PE热解模拟参数设置

• echo both：同时回显到屏幕和日志，日志文件默认为当前路径下的log.lammps，需要注意，如果该文件已经存在，内容会被覆盖。为了防止日志丢失（如电脑/shell重启等会导致屏幕日志消失），推荐使用both
• boundary p p p：只是热解，不考虑气体溢出以及气液固分离等情况，设置周期性
• dimension 3：三维立方体盒子，设置为3维
• units real：采用real（真实世界一致）单位类型，如温度单位K，大气压力，密度g/cm^3等

• atom_style charge：需要计算库仑相互作用，选择带电荷的原子类型charge

03 in文件参考内容

in文件初始化部分完整参考内容：

# in.file for PE pyrolysis
# ----------- Initialization -----------
echo         both
units        real
atom_style   charge
dimension    3
boundary     p p p

到此，初始化部分可以跑起来了。将以上文件复制到in.initialization文件中，然后执行如下命令即可：

lmp -in  in.initialization

LAMMPS (29 Sep 2021 - Update 2)
using 1 OpenMP thread(s) per MPI task
Total wall time: 0:00:00

还没有安装Lammps的朋友可参考：
全网最简单Lammps(Ubuntu)安装教程

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书山有路勤为径，学海无涯苦作舟。今天就到这里啦，拜了个拜~

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