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码农小C
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从一个被更新后的GTF文件得到geneID和gene类型的对应关系
在复现GEO数据挖掘-第一期-胶质母细胞瘤(GBM)时,前面都一帆风顺,但是到第二步 得到geneID和gene类型的对应关系时,遇到了钉子。解决步骤:https://zhuanlan.zhihu.com/p/108746782原创 2020-12-09 21:02:36 · 928 阅读 · 0 评论 -
关于Rstudio最新版本中Biobase和GEOquery安装的问题
关于Rstudio最新版本中Biobase和GEOquery安装的问题本来是3.6版本R,但是我的4.03版本的R也安装成功了。if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“GEOquery”)bioBase 安装类似:if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE))ins原创 2020-12-09 20:58:57 · 10464 阅读 · 6 评论 -
Rstudio安装包失败,换源
首先安装包的时候,打开R,不是打开Rstudio,打开R后输出install.packages()选择完中国的服务器,出现以下错误:解决方法:进入到R的安装目录,如下图的这个文件,用记事本打开D:\Program Files\R\R-4.0.3\etc\Rprofile.site在下图的位置处添加 options(download.file.method=“libcurl”),保存退出,重新打开Rstudio即可。...原创 2020-11-29 15:27:09 · 4565 阅读 · 2 评论 -
R语言软件安装
第一步:先下载R软件R软件下载地址: http://cran.r-project.org选择Downlaod for Windows选择base选择Download R 4.0.3 for Windows下载即可第二步:安装R软件双击打开下载好的.exe文件,一直默认选项进行安装。安装成功后,在开始选项里会有两个,分别是R x64 4.0.3和 R i386 4.03前者是64位的,后者是32位的,无所谓。鼠标点住拖动到桌面即可创建创面快捷方式。双击打开如图所示:恭喜,安装成功。注意原创 2020-11-28 15:11:40 · 629 阅读 · 0 评论