最近在学习GNN图卷积,要安装一个包torch-geometric,遇到这个问题,折腾了好几天,看了网上好多博客,自己总结了一个。
步骤 1:是否有 libcusparse.so.11 文件
- 得正确安装torch-geometric,这个包是要根据自己安装的torch版本安装的,而且这个还需要下载好几个依赖包,且有顺序,网上有很多说明,可以自己去搜搜看。
- 去自己虚拟环境下的lib文件夹看看是否有 libcusparse.so.11 这个文件,如果没有,可以下载一个,放在lib文件夹里:
链接:https://pan.baidu.com/share/init?surl=BmCV7pxsx0rtyFvLLfJ4PQ
提取码:1313
步骤 2:配置环境变量
根据自己虚拟环境配置:
export PATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/bin:$PATH
export CPATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/include:$CPATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export DYLD_LIBRARY_PATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/lib:$DYLD_LIBRARY_PATH
还可以验证是否配置正确:
echo $PATH
echo $CPATH
echo $LD_LIBRARY_PATH
echo $DYLD_LIBRARY_PATH
步骤 3:修改~/.bashrc文件
先找到.bashrc文件所在位置,我的是在 /home/wn/.bashrc
locate .bashrc
/home/wn/.bashrc
然后打开.bashrc文件, i 键进入编辑模式
vi ~/.bashrc
在.bashrc文件最下面加入:
export PATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/bin:$PATH
export LIBRARY_PATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/lib:$LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/lib:$LD_LIBRARY_PATH
esc 退出编辑模式, :wq 保存并退出,然后激活一下
source ~/.bashrc
这时在自己对应的虚拟环境下 ( 我的就是 torch_gpu ),激活 python,输入:
from torch_sparse import SparseTensor
如果什么都没返回,证明已经可以调用libcusparse.so.11这个文件了,如果没有,那就反复检查上面几个步骤。
此时已经可以在终端运行了,但是还不能在Pycharm中的run运行
步骤 4:在pycharm的菜单栏run配置运行环境
Run --> Edit Configurations
到这个界面:
是在要运行torch-geometric的.py文件下的 Environment variables 中添加,我这是mian.py,添加:
Name: LD_LIBRARY_PATH
Value: /home/wn/anaconda3/envs/torch_gpu/lib:$LD_LIBRARY_PATH
(根据自己写的路径来)
这时候应该就可以正常在pycharm运行了。