linux使用ftp命令批量传fastaq文件(scidb/生信/0基础)

本文介绍了如何使用Linux的ftp命令批量上传100个FASTAQ文件(.fq.gz)到Science Data Bank(Scidb)。首先提供Scidb的FTP登录信息,然后详细说明如何将文件软链到同一文件夹下,最后引用了两个参考资料,为用户提供完整的上传和下载文件的步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1.

往science data bank (scidb)上传数据的时候对方给出ftp地址如下

地址: ftp://ftp.scidb.cn:2121
账号: ******
密码: ******

[D:\~]$ ping ftp.scidb.cn

正在 Ping ftp.scidb.cn [60.245.194.36] 具有 32 字节的数据:
请求超时。

60.245.194.36 的 Ping 统计信息:
    数据包: 已发送 = 1,已接收 = 0,丢失 = 1 (100% 丢失),
^C

2.

上传数据有2个文件夹,一共100个fastaq文件(.fq.gz),软链到一个文件夹下

(base) Thu May 12 21:06:57 /data3/user/transport_data/ (6)
$mkdir trans
(base) Thu May 12 21:07:03 /data3/user/transport_data/ (7)
$cd trans/
(base) Thu May 12 21:07:05 /data3/user/transport_data/trans/ (0)
$ls
(base)Thu May 12 21:07:05 /data3/user/transport_data/trans/ (0)
$ln -s ../16.tissue/
aspera.openssh   b38_1.fq.gz      b47_1.fq.gz.md5  b50_2.fq.gz      b55_2.fq.gz.md5  b59_1.fq.gz      fq/
b35_1.fq.gz      b38_1.fq.gz.md5  b47_2.fq.gz      b50_2.fq.gz.md5  b57_1.fq.gz      b59_1.fq.gz.md5  GSA.bash.sh
b35_1.fq.gz.md5  b38_2.fq.gz      b47_2.fq.gz.md5  b53_1.fq.gz      b57_1.fq.gz.md5  b59_2.fq.gz      list
b35_2.fq.gz      b38_2.fq.gz.m
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