BraTs系列比赛

脑肿瘤分割挑战赛(Brain Tumor Segmentation, BraTS Chanllenge)是国际医学图像计算和计算机辅助干预协会(Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention Society,MICCAI)联合举办的。自2012年以来,已经连续举办十几年,BraTS一直致力于生成用于描述成人脑胶质瘤的基准环境和数据集。每年的数据集和挑战任务都会进行一些改变。

关于数据集

胶质瘤可以分为:

HGG :高级别胶质瘤(WHO3~4级)为低分化胶质瘤;这类肿瘤为恶性肿瘤,患者预后较差。LGG :低级别胶质瘤(WHO1~2级)为分化良好的胶质瘤;虽然这类肿瘤在生物上并不属于良性肿瘤,但是患者的预后相对较好。   

BraTS数据集以HGG和LGG作为区分。其中每一个文件夹里有一个人的大脑核磁共振图像,包括四种3D MRI 模态(T1,T1c,T2,and FLAIR)。所有成像数据集都由一到四名评分员按照相同的注释协议手动分割,并且他们的注释由经验丰富的委员会认证的神经放射科医生批准。注释包括GD增强肿瘤(ET-标记4)、瘤周水肿/侵袭组织(ED-标记2)和坏死肿瘤核心(NCR-标记1),其中背景标记为0。

关于模态信息具体可以参考:(27条消息) 医学影像分割入门MRI关于T1、T2、Flair等概念_t1flair与t2flair区别_Owenhhhh的博客-CSDN博客

总数训练数验证数测试数
20125035N/A15
20136035N/A25
2014238200N/A38
2015253200N/A53
2016391200N/A191
201747728546146
201854228566191
2019626335125166
2020660369125166
202120401251219570
20221251

论文参考:

[1] Soltaninejad M .Identifying the Best Machine Learning Algorithms for Brain Tumor Segmentation, Progression Assessment, and Overall Survival Prediction in the BRATS Challenge[J].  2019.

关于任务

2018年

专注于内在异质性(外观、形状和组织学)脑肿瘤(即胶质瘤)的分割

专注于预测患者的总体生存期

评估肿瘤分割中的算法不确定性 

2019年

专注于内在异质性(外观、形状和组织学)脑肿瘤(即胶质瘤)的分割

专注于预测患者的总体生存期

评估肿瘤分割中的算法不确定性 

2020年

主要关注内在异质性(外观、形状和组织学)脑肿瘤(即胶质瘤)的分割(任务 1)

专注于患者总生存期的预测 (任务2)

评估肿瘤分割中的算法不确定性 (任务3)

2021年

重点评估了在mpMRI扫描中分割本质异质性脑胶质母细胞瘤亚区的最先进方法(任务1)

BraTS 2021的挑战还集中在评估(任务2)分类方法,以预测MGMT启动子甲基化状态

2022年

暂时没查到,后续更新

2023年

今年挑战的重点仍然是生成一个通用的基准环境,但其数据集已大幅扩展至约4500例,以解决额外的i)人群(如撒哈拉以南非洲患者)、ii)肿瘤(如脑膜瘤)、iii)临床问题(如数据缺失)和iv)技术考虑(如扩增)。具体而言,BraTS 2023的重点是确定当前最先进的算法,用于解决(任务1)与RSNA-ANSR-MICCAI BraTS挑战中相同的成人神经胶质瘤群体,以及(任务2)服务不足的撒哈拉以南非洲脑胶质瘤患者群体,(任务3)颅内脑膜瘤,(任务4)脑转移,(任务5)儿童脑肿瘤患者,(任务7和8)全局和局部缺失数据,(任务9)有用的扩充技术,重要的是(任务6)任务1-5的算法可推广性。每个“任务”的详细信息在本文档的其余部分“挑战”下列出

以上有不正确的地方,欢迎大家指出。

官网介绍:Brain Tumor Segmentation (BraTS) Challenge | CBICA | Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania (upenn.edu)

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