jiaven_77-CSDN博客

原创 CUDA | RTX3070 | Pytorch 版本对应| 深度学习加速器

这个教程在b站和网上很多，但是随着软件更新，包的冲突问题也越来越明显，所以在这里记录我的版本。

2024-06-20 21:04:49 843 1

原创 KNN和ANN的异同 |

在基于图的ANN算法中，如何构造图的结构至关重要，更准确一些来说的话，是边的构造至关重要。在后面的章节中，本文会针对一些图算法和结构，例如Delaunay Graph，Monotonic Search Network，Relative Neighborhood Graphs等进行深入的探讨。一般来说，精准找到K个最近邻往往代价很大，所以在实际应用中，KNN问题常常被弱化成ANN (Approximate Nearest Neighbor) 问题，即近似最近邻问题。，找到的一定是最近的K个点；

2024-04-02 16:56:44 724 1

原创 UMAP的内置算法 | Nearest-Neighbor-Descent | K近邻图

散列表（Hash table，也叫哈希表），是根据键（Key）而直接访问在内存存储位置的数据结构。也就是说，它通过计算一个关于键值的函数，将所需查询的数据映射到表中一个位置来访问记录，这加快了查找速度。这个映射函数称做哈希函数，存放记录的数组称做哈希表。

2024-04-02 16:50:22 823 1

原创降维算法 | PCA | UMAP | t-SNE

降维是指通过保留一些比较重要的特征，去除一些冗余的特征，减少数据特征的维度。单细胞聚类的一般步骤有：数据质控，基因筛选，PCA降维，以及基于PCA预降维空间的聚类和进一步的降维可视化。

2024-04-02 11:00:03 1447 1

原创统计检验 | t分布|F分布|卡方分布|ANOVA

在统计学假设检验中，我们会先提出一个原假设（null hypothesis），记为H0。1类错误（）我们拒绝了一个真的原假设(就是图中的FP)2类错误（是我们没有拒绝一个错误的原假设(就是图中的FN)。剩下两种情况（TP、TN），我们说检验对样本做了正确的预测。

2024-04-01 17:02:10 893

原创 GSEA和KEGG以及GO的区别

当产生的表达差异矩阵后，做后续的分析：1.KEGG是通路富集分析2.GO是功能富集分析，包括BP分析，CC分析以及MF分析。。传统KEGG（通路富集分析）和GO（功能富集）分析时，如果富集到的同一通路下，既有上调差异基因，也有下调差异基因，那么这条通路总体的表现形式究竟是怎样？是被抑制还是激活？或者更直观点说，这条通路下的基因表达水平在实验处理后是上升了呢，还是下降了呢?

2024-04-01 12:08:12 2164