openjudge DNA排序

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5:DNA排序

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描述
现在有一些长度相等的DNA串(只由ACGT四个字母组成),请将它们按照逆序对的数量多少排序。
逆序对指的是字符串A中的两个字符A[i]、A[j],具有i < j 且 A[i] > A[j] 的性质。如字符串”ATCG“中,T和C是一个逆序对,T和G是另一个逆序对,这个字符串的逆序对数为2。

输入
第1行:两个整数n和m,n(0<n<=50)表示字符串长度,m(0<m<=100)表示字符串数量

第2至m+1行:每行是一个长度为n的字符串
输出
按逆序对数从少到多输出字符串,逆序对数一样多的字符串按照输入的顺序输出。
样例输入
10 6
AACATGAAGG
TTTTGGCCAA
TTTGGCCAAA
GATCAGATTT
CCCGGGGGGA
ATCGATGCAT

样例输出
CCCGGGGGGA
AACATGAAGG
GATCAGATTT
ATCGATGCAT
TTTTGGCCAA

TTTGGCCAAA


==========================================================================

以归并算法为框架的求逆序对数目(时间复杂度O(nlogn))+冒泡排序。


代码清单:

#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <cstring>
using namespace std;

#define MAXLEN 55
#define MAXN 105

typedef struct _DNAinfo
{
	char DNAseq[MAXLEN];
	int invs;
} DNAinfo;

DNAinfo DNAdata[MAXN];

int Merge(int a[], int tempa[], int left, int right, int mid)
{
	for (int i=left; i<=right; ++i)
	{
		tempa[i]=a[i];
	}

	int cursor=left;
	int index1=left;
	int index2=mid+1;
	int delta=0;

	while (index1<=mid && index2<=right)
	{
		if(tempa[index1]<=tempa[index2])	a[cursor++]=tempa[index1++];
		else
		{
			a[cursor++]=tempa[index2++];

			delta += (mid-index1+1);
		}
	}

	while(index1<=mid)	a[cursor++]=tempa[index1++];
	while(index2<=right) a[cursor++]=tempa[index2++];

	return delta;
}

void MergeCountInvs(int a[], int tempa[], int left, int right, int *cnt)
{
	int mid=(left+right)/2;

	if (left<right)
	{
		MergeCountInvs(a, tempa, left, mid, cnt);
		MergeCountInvs(a, tempa, mid+1, right, cnt);

		(*cnt) += Merge(a, tempa, left, right, mid);
	}
}

void Swap(DNAinfo *info1, DNAinfo *info2, int n)	//我晕,写了这么久代码还会在“swap函数应该传地址”上面栽跟头,不应该不应该。
{
	char tempc[MAXLEN];
	int tempint;

	memcpy(tempc, info1->DNAseq, n);
	tempint=info1->invs;

	memcpy(info1->DNAseq, info2->DNAseq, n);
	info1->invs=info2->invs;

	memcpy(info2->DNAseq, tempc, n);
	info2->invs=tempint;
}

//数据量不大,且需要稳定排序,故选择冒泡
void BubbleSortByInvs(DNAinfo DNAdata[], int m, int n)
{
	bool NoSwap;	//设立NoSwap标志位

	for (int i=0; i<m-1; ++i)	//从队首开始扫描序列
	{
		NoSwap=true;
		for (int j=m-1; j>i; --j)	//从队尾冒泡
		{
			if (DNAdata[j].invs < DNAdata[j-1].invs)	//把小的换到前面来
			{
				Swap(&(DNAdata[j]), &(DNAdata[j-1]), n);
				NoSwap=false;
			}
		}
		if(NoSwap==true)
			return;
	}
}

int main()
{
	freopen("D:\\in.txt", "r", stdin);
	freopen("D:\\out.txt", "w", stdout);

	int a[MAXLEN], tempa[MAXLEN];
	int cnt;

	int n, m;
	scanf("%d%d", &n, &m);

	for (int i=0; i<m; ++i)
	{
		scanf("%s", DNAdata[i].DNAseq);

		for (int j=0; j<n; ++j)
		{
			a[j]=DNAdata[i].DNAseq[j];
		}

		cnt=0;
		MergeCountInvs(a, tempa, 0, n-1, &cnt);
		DNAdata[i].invs=cnt;
	}

	BubbleSortByInvs(DNAdata, m, n);

	//输出
	for (int i=0; i<m; ++i)
	{
		printf("%s\n", DNAdata[i].DNAseq);
	}

	return 0;
}

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