【有啥问啥】关于聚类算法（Clustering）：你想要了解的都在这里

关于聚类算法（Clustering）：你想要了解的都在这里

聚类算法概述

聚类是一种无监督学习方法，旨在根据数据点的相似性将其划分为多个组（簇）。与分类任务不同，聚类不依赖于预先标记的数据集，而是根据数据本身的特征进行分组。聚类算法广泛应用于图像处理、文本分析、市场细分、生物信息学等领域，帮助我们发现数据中的潜在结构和模式。

举个栗子

假设你是一名图书管理员，负责将大量书籍分类整理。书籍既没有明确的类别标签，也没有事先分好类的目录。你面前的任务是根据书籍的内容、作者、封面风格等特征，将这些书籍分成几类，比如小说、历史、科学等。

在你手头上有一本书后，你需要决定这本书应该放在哪一类。这时候，你可能会做以下几件事情：

1. 观察书籍的特征：比如书的封面颜色、标题、作者、内容简介等。
2. 根据相似性分组：将内容相似的书放在一起。例如，所有关于历史的书放在同一类，而所有科幻小说放在另一类。
3. 调整分组：随着你处理的书越来越多，你可能会发现某些书应该移到另一个组，或者某个组可以再细分成多个更小的组。

这就是聚类算法的核心思想：根据数据的特征，将相似的数据点分成组，而这些组就是所谓的“簇”。在实际应用中，我们通常不会手动去观察和分类，而是依靠算法根据数据的相似性自动完成这些任务。

在选择聚类算法时，需要考虑数据的特性、算法的计算复杂度，以及目标应用的需求。不同的聚类算法在处理簇的形状、规模和分布上表现各异，因此理解这些算法的工作原理和应用场景是至关重要的。接下来，我们将详细介绍几种常见的聚类算法，包括K-means、层次聚类、DBSCAN、谱聚类、高斯混合模型（GMM）和亲和力传播。

1. K-均值聚类（K-means Clustering）

工作原理

K-均值聚类通过迭代优化簇内点与簇中心的距离，最终得到K个簇。算法的步骤如下：

1. 初始化：随机选择K个点作为初始聚类中心。
2. 分配数据点：根据欧氏距离等度量方法，将每个数据点分配到最近的聚类中心。
3. 更新聚类中心：计算每个簇内所有点的均值，并将其作为新的聚类中心。
4. 重复：上述步骤重复进行，直到聚类中心不再发生显著变化或达到预设迭代次数。

数学公式

K-均值算法的目标是最小化以下代价函数：

$$J=\sum _{i=1}^K\sum _{x\in C_i}\Vert x-{\mu }_i{\Vert }^2$$

其中，$C_i$ 是第 $i$ 个簇的集合，${\mu }_i$ 是第 $i$ 个簇的中心，$\Vert x-{\mu }_i\Vert$ 是数据点 $x$ 到簇中心 ${\mu }_i$ 的距离（通常使用欧氏距离）。

Python代码示例

import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
import matplotlib.pyplot as plt

# 生成数据集
X = np.random.rand(100, 2)

# K-means聚类
kmeans = KMeans(n_clusters=3, random_state=42)
kmeans.fit(X)
labels = kmeans.labels_

# 可视化结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.scatter(kmeans.cluster_centers_[:, 0], kmeans.cluster_centers_[:, 1], s=300, c='red')
plt.show()

优缺点

• 优点：
  • 算法简单且计算速度快，尤其适合大数据集。
  • 算法在簇呈现均匀、球形分布时效果较好。
• 缺点：
  • 需要预先指定K值，可能难以确定。
  • 对初始聚类中心的选择敏感，可能导致不同的聚类结果。
  • 不能有效处理非球形簇，易受噪声和异常值影响。

应用场景

K-means常用于分布较为均匀且簇大小相似的数据集。实际应用包括客户细分、市场营销中的用户分类、图像分割等。在这些场景中，数据通常可以自然地分为多个组，且每组内部相似性较高。

2. 层次聚类（Hierarchical Clustering）

工作原理

层次聚类分为凝聚层次聚类和分裂层次聚类。凝聚层次聚类从每个点作为单独的簇开始，逐步合并相似的簇，直到所有点形成一个簇或达到某个停止条件；而分裂层次聚类则从一个簇开始，逐步分裂成更小的簇。

数学公式

凝聚层次聚类的核心是计算簇之间的距离，常用的距离度量包括：

• 最小距离（单链接，Single Linkage）：
  $$D_{\text{min}}(C_i,C_j)=\underset{x\in C_i,y\in C_j}{\min }\Vert x-y\Vert$$
• 最大距离（全链接，Complete Linkage）：
  $$D_{\text{max}}(C_i,C_j)=\underset{x\in C_i,y\in C_j}{\max }\Vert x-y\Vert$$
• 平均距离（平均链接，Average Linkage）：
  $$D_{\text{avg}}(C_i,C_j)=\frac{1}{|C_i||C_j|}\sum _{x\in C_i}\sum _{y\in C_j}\Vert x-y\Vert$$

Python代码示例

from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
import matplotlib.pyplot as plt

# 生成数据集
X = np.random.rand(50, 2)

# 层次聚类
Z = linkage(X, 'ward')

# 绘制树状图
dendrogram(Z)
plt.show()

优缺点

• 优点：
  • 不需要预先指定簇的数量。
  • 能够发现任何形状的簇，适应性强。
• 缺点：
  • 计算复杂度高，特别是对于大数据集。
  • 聚类结果依赖于合并或分裂策略的选择，可能不是全局最优。

应用场景

层次聚类适用于分析不确定簇数量或簇大小多样的数据集。例如，生物信息学中的基因表达分析、社交网络中社区结构分析等。其层次化的结果也便于可视化和解释。

3. DBSCAN（Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise）

工作原理

DBSCAN根据数据点的密度进行聚类。算法通过定义一个ε-邻域和最小点数MinPts来识别密度核心点，并根据密度可达性将这些核心点连接成簇。与传统的基于距离的聚类算法不同，DBSCAN能够识别任意形状的簇，并有效处理噪声点。

数学公式

DBSCAN聚类的关键在于定义密度可达性：

• ε-邻域：对于一个点 $p$，定义半径为 $\epsilon$ 的邻域 $N(p)$ 包含所有与 $p$ 的距离小于 $\epsilon$ 的点。
• 密度可达性：如果点 $p$ 在点 $q$ 的ε-邻域内且 $q$ 是密度核心点，那么 $p$ 被认为是密度可达的。

Python代码示例

from sklearn.cluster import DBSCAN
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# 生成数据集
X = np.random.rand(100, 2)

# DBSCAN聚类
dbscan = DBSCAN(eps=0.1, min_samples=5)
labels = dbscan.fit_predict(X)

# 可视化结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.show()

优缺点

• 优点：
  • 能够识别任意形状的簇，不依赖于球形假设。
  • 对噪声和异常值具有鲁棒性。
• 缺点：
  • 需要选择合适的ε和MinPts参数，选择不当可能导致聚类效果不佳。
  • 在高维数据中，ε-邻域的选择变得更加困难。

应用场景

DBSCAN在地理空间数据分析、图像处理以及社交网络分析中表现突出。例如，地理信息系统中用于检测异常区域或热点区域，或在社交网络中检测社区结构。

4. 谱聚类（Spectral Clustering）

工作原理

谱聚类利用图论中的拉普拉斯矩阵进行

数据嵌入，通过在低维空间中执行K-means等算法来完成聚类。它特别适用于处理复杂形状的簇。

数学公式

谱聚类的关键是构建图的拉普拉斯矩阵：

$$L=D-W$$

其中，$L$ 是拉普拉斯矩阵；$D$ 是度矩阵，对角线上元素 $d_{ii}$ 是数据点的度数；$W$ 是相似度矩阵，其元素 $w_{ij}$ 表示点 $i$ 和点 $j$ 之间的相似度。

谱聚类通过求解以下特征值问题：
$$L\mathbf{v}=\lambda \mathbf{v}$$
选择前 $k$ 个最小的非零特征值对应的特征向量作为数据的嵌入表示。

Python代码示例

from sklearn.cluster import SpectralClustering
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# 生成数据集
X = np.random.rand(100, 2)

# 谱聚类
spectral = SpectralClustering(n_clusters=3, affinity='nearest_neighbors')
labels = spectral.fit_predict(X)

# 可视化结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.show()

优缺点

• 优点：
  • 能够有效处理复杂形状的簇。
  • 不受噪声和异常值的影响。
• 缺点：
  • 计算复杂度高，尤其是在大规模数据集上。
  • 构建相似度矩阵时需要选择合适的参数（如邻居数或高斯核的带宽）。

应用场景

谱聚类适用于社交网络分析、图像分割和文档聚类等领域。在这些应用中，数据往往呈现复杂的结构或高维空间的稀疏性，谱聚类能够有效处理这些挑战。

5. 高斯混合模型（Gaussian Mixture Model, GMM）

工作原理

高斯混合模型是一种概率模型，假设数据点是由多个高斯分布混合生成的。与K-means不同，GMM考虑了每个簇的概率分布，从而可以处理簇的形状、大小和密度不均匀的情况。算法通过期望最大化（EM）算法迭代更新参数，直到模型收敛。

• 传送门链接: 多维高斯分布（Multivariate Gaussian Distribution，MGD）的采样过程是什么样的？

数学公式

GMM的目标是最大化以下对数似然函数：
$$\log L(\theta )=\sum _{i=1}^n\log \left(\sum _{j=1}^k{\pi }_j\mathcal{N}(x_i|{\mu }_j,{\Sigma }_j)\right)$$
其中，${\pi }_j$ 是第 $j$ 个高斯分布的混合系数，$N(x_i|{\mu }_j,{\Sigma }_j)$ 是数据点 $x_i$ 在第 $j$ 个高斯分布上的概率密度函数。

Python代码示例

from sklearn.mixture import GaussianMixture
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# 生成数据集
X = np.random.rand(100, 2)

# 高斯混合模型
gmm = GaussianMixture(n_components=3, covariance_type='full')
gmm.fit(X)
labels = gmm.predict(X)

# 可视化结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.show()

优缺点

• 优点：
  • 可以处理簇的形状、大小和密度不均匀的情况。
  • 提供了簇归属的概率估计，使得聚类更加灵活。
• 缺点：
  • 对初始参数敏感，可能陷入局部最优。
  • 计算复杂度较高，尤其是在高维数据中。

应用场景

GMM在模式识别、语音识别、图像处理等领域有广泛应用。例如，在语音识别中，GMM用于建模语音信号的特征分布，从而实现对不同语音的分类。

6. 亲和力传播（Affinity Propagation）

工作原理

亲和力传播是一种基于消息传递的聚类算法，不需要预先指定簇的数量。算法通过将数据点作为“候选中心”进行相互通信，逐步选择出最合适的簇中心并分配数据点。

数学公式

亲和力传播通过两个关键矩阵实现：

• 责任矩阵 $R(i,k)$：表示数据点 $i$ 认为点 $k$ 作为簇中心的适合度。
• 可用性矩阵 $A(i,k)$：表示点 $k$ 作为簇中心对点 $i$ 的吸引力。

更新公式为：
R ( i , k ) = s ( i , k ) − max ⁡ k ′ ≠ k { A ( i , k ′ ) + s ( i , k ′ ) } R(i, k) = s(i, k) - \max_{k' \neq k} \{A(i, k') + s(i, k')\} R(i,k)=s(i,k)−k′=kmax​{A(i,k′)+s(i,k′)}
A ( i , k ) = min ⁡ { 0 , R ( k , k ) + ∑ i ′ ≠ i , i ′ ≠ k max ⁡ ( 0 , R ( i ′ , k ) ) } A(i, k) = \min\{0, R(k, k) + \sum_{i' \neq i, i' \neq k} \max(0, R(i', k))\} A(i,k)=min{0,R(k,k)+i′=i,i′=k∑​max(0,R(i′,k))}
其中，$s(i,k)$ 是点 $i$ 和点 $k$ 之间的相似度。

Python代码示例

from sklearn.cluster import AffinityPropagation
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# 生成数据集
X = np.random.rand(100, 2)

# 亲和力传播聚类
affprop = AffinityPropagation(random_state=42)
labels = affprop.fit_predict(X)

# 可视化结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.show()

优缺点

• 优点：
  • 不需要预先指定簇的数量，自动选择簇中心。
  • 适用于处理复杂的相似性结构。
• 缺点：
  • 对相似度矩阵的定义敏感，可能导致不稳定的聚类结果。
  • 计算复杂度较高，尤其在大数据集上。

应用场景

亲和力传播适用于图像分类、文档分类和生物信息学中的基因表达分析等。在这些领域中，数据的相似性结构往往复杂，且簇的数量难以预先确定，亲和力传播提供了灵活的聚类解决方案。

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这篇文章通过通俗易懂的案例介绍了聚类算法的基本概念，并深入解析了几种常见的聚类算法，包括K-means、层次聚类、DBSCAN、谱聚类、高斯混合模型和亲和力传播。每种算法都有各自的优缺点和适用场景，选择合适的算法取决于数据的特性和具体的应用需求。希望这篇文章能帮助你更好地理解和应用聚类算法。