Carthagene安装

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分类专栏： 生物信息 文章标签： 遗传连锁图 QTL
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Carthagene安装
最近在写文章，需要用carthagene做遗传连锁图。记录下安装过程。
下载地址：
http://mulcyber.toulouse.inra.fr/frs/download.php/1199/carthagene-1.3.beta-Linux-x86_64.sh
我的是centos6，所以我下载的是x86_64
当然安装之前需要安装一些依赖包:
• tcl
• tk
• tcllib
• tklib
• itcl
• itk
• bwidget
• iwidgets
• blt
• tclreadline or tclx (prefer tclreadline if available; command history is not available when using tclx.)

或者直接安装ActiveTcl (at least 8.4)。
不安装ActiveTcl ，需要使用 yum install 安装依赖包
安装完依赖包之后，可以直接运行
./carthagene-1.3.beta-Linux-x86_64.sh
注意你的安装路径，安装之后会出现两个文件夹 bin和share
，bin下就一个carthagene 命令，可加入到全局环境变量里，
share下有一个 carthagene文件夹，需要使用下面的命令拷贝
cp /share/carthagene /usr/share/carthagene
至此

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