两个文件的合并

这篇博客介绍如何合并两个文件,其中一个文件是gff3格式,它们有一列共同的内容,通过这列内容进行结合。文章提供了相关代码实现。

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两个文件的合并

分别有文件一和文件二,文件一和文件二都有一列内容是相同的。根据此列内容可将两者结合起来。

文件一的格式如下

<
AEGTA04333 LOC_Os01g33520|LOC_Os01g33520.1 2.70E-25 LOC_Os01g33520|LOC_Os01g33520.1 PF02902 Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain0 Correction_xiaoyan_191014
Bradi5g13350|Bradi5g13350.2 0.00E+00 Bradi5g13350|Bradi5g13350.2PF01179 Copper amine oxidase, enzyme domain0 1.4.3.21 Primary-amine oxidase. primary-amine oxidase [EC:1.4.3.21] K00276 gi|1027548131|dbj|IAAQ01032233.1| LOC_Os08g23710|LOC_Os08g23710.1
7.40E-96 LOC_Os08g23710|LOC_Os08g23710.1 PF01248 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family0 60S ribosomal protein L7A KOG3166 large subunit ribosomal protein L7Ae K02936 TRIUR3_19210 ChrSy.fgenesh.gene.7|ChrSy.fgenesh.mRNA.7 8.40E-140
ChrSy.fgenesh.gene.7|ChrSy.fgenesh.mRNA.7 PF07727 Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)0 2.7.7.49 RNA-directed DNA polymerase. gb|GEDQ01040680.1| Bradi3g35480|Bradi3g35480.1 9.30E-28 Bradi3g35480|Bradi3g35480.1
0 gi|1027446095|dbj|IAAV01016872.1| Bradi3g26410|Bradi3g26410.1 4.90E-305 Bradi3g26410|Bradi3g26410.1 PF03372
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