muhamuha2020的博客

中医药研究一直以来都是医学中备受瞩目的领域，传承千年的中华医药文化，蕴含着宝贵的智慧和经验。现代科技的不断发展让我们有机会以前所未有的方式深入探索中医药的奥秘。为了更好地理解中药的作用机制，我们需要采用现代科学方法，深入探索每个中药成分在不同个体中的影响。这正是多组学技术的用武之地。派森诺公司为中医药研究领域推出了一系列专门的多组学技术产品，将为您的研究提供全新的思路和工具。派森诺考虑中医药研究的特点结合现代高通量测序手段，编写了《多组学技术在中医药研究领域的应用》手册，让我们来看看看材料中都有哪些内容吧

根据不同的遗传群体材料和遗传设计，有针对自然群体的Δ（SNP-index）、有针对EMS诱变材料的MutMap法（Abe et al., 2012）、针对无亲本只有两个极端混池的欧氏距离法（ED）（Hill et al., 2013）、基于一个大的F2群体并依据表型分组（三组以上）的GradedPool-seq（GPS）法（Wang et al., 2019）和较复杂的遗传设计QTG-seq法（Zhang et al., 2019a）等；R1：突变体表型特征和遗传分析（细致的性状调查是成功的第一步）

默认绘制的四层图表分别是热图（常用于显示P值等数据），散点图（常用于显示上调倍数等数据），折线图（常用于显示上调倍数均值等数据），柱状图（常用于显示上调基因下调基因表达等数据），额外增加的两层分别是散点图和柱状图，每个圈层均可切换以上四种图表类型。根据上传的数据，默认将第四列到最后一列所有value值当作热图数据作图，我们可以通过勾选列名来筛选实际热图数据作图，或选择热图数据中部分value值在图上显示。既可以调整轨道（环形）与轨道之间的间距，也可以调整染色体（扇形）与染色体之间的间距。...

最近，派森诺与中国科学院昆明植物研究所合作，在《Microbiology Spectrum》发表论文，通过微生物组测序和微生态群落分析，对外生菌根真菌群落时空分布特征进行了解析。01、研究背景外生菌根真菌（Ectomycorrhizal fungi，EcM fungi）对森林生态系统的稳定和平衡具有重要作用。外生菌根真菌能在地下形成菌丝网络，促进植物宿主的水分和养分吸收，增强植物的逆境耐受性，有利于植物幼苗的定植和种群的建立。外生菌根真菌群落多样性及其生态功能会随气候发生相应变化，进而影响其宿主植物种

派森诺与华中农业大学合作，在Molecular Plant上发表了题为《Genome- and transcriptome-wide association studies provide insights into the genetic basis of natural variation of seed oil content in Brassica napus》的研究结果。该研究为提高甘蓝型油菜和其他油料作物的有机碳提供了丰富的遗传资源，并为理解油菜和其他油料作物种子中油分积累的复杂机制提供了有价值

派森诺与上海市农业科学院携手合作，于近期在《Postharvest Biology and Technology》上发表了β-葡萄糖苷酶抑制剂在草菇采后管理中应用的研究成果。草菇(Volvariella volvacea)又称兰花菇，味道鲜美，营养丰富，脂质含量低。低温贮藏是大多数食用菌保存和运输的常规方法。然而，在传统的保存温度(4℃)下，草菇会变软、液化，甚至腐烂，这种现象被称为“低温自溶”。草菇的低温自溶限制了这种商业栽培蘑菇的采后贮藏和销售。已有研究表明，UBEV2特异性泛素结合酶E2 (UBEV

派森诺与复旦大学附属华东医院的张艳梅老师课题组合作，在微生物学与免疫学领域的《Virulence》发表新研究成果！在本研究中，从临床上分离得到若干个幽门螺杆菌，对这些菌株进行高通量测序，确定了幽门螺杆菌的特定遗传特征和与特定临床结果相关的遗传特异性，并确定这些基因的功能，这些数据拓宽了对幽门螺杆菌的多样性及其与特定胃疾病关系的认识。研究背景幽门螺杆菌(H.pylori)感染是严重胃炎相关疾病的重要危险因素，包括消化性溃疡、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤、胃癌。世界上有40%以上的人口长期感染H.pylori，

近期，派森诺与华东师范大学合作，在知名期刊《Journal of Hazardous Materials》上发表论文，通过宏转录组学研究，解析了餐厨垃圾和污泥厌氧共消化处理系统中，抗生素暴露对功能微生物物质代谢和产甲烷活性的影响，并揭示了抗生素暴露抑制厌氧消化过程的微生物作用机制。研究背景餐厨垃圾和污泥厌氧共消化处理系统是一种高效且极具潜力的有机固废资源化利用技术。但污泥中的抗生素残留也会进入到厌氧消化系统中，而关于抗生素对消化过程中功能微生物和代谢通路的作用机制尚缺乏研究。本研究利用高通量测序技术，

泰乐菌素(TYN)是一种常用的大环内酯类抗生素，可有效对抗革兰氏阳性菌，并可作为兽药用于预防肠道和呼吸道感染。TYN残留物可以通过在农田中施用粪肥和泻湖废水进入环境，值得注意的是，全球地表水中已检测到浓度高达3.06 μg L-1的TYN。已有研究表明，TYN对藻类的生长和发育产生不利影响。TYN能够抑制铜绿微囊藻和羊角月牙藻的叶绿素合成，进而抑制其光合作用。此外，TYN降低了铜绿微囊藻和羊角月牙藻的生长性能和增殖能力。羊角月牙藻是经济合作与发展组织(OECD)推荐的生态毒理试验模式藻类，因为它分布全球，

去年，我们报道过与上海交通大学孟和教授团队的合作成果，通过“微生物组—宿主基因组”关联研究（mGWAS），探讨宿主基因组、肠道微生物组和鸡白痢沙门氏菌感染之间的联系，并发现了白痢病鸡肠道菌群的可遗传特征，研究成果发表于微生态领域知名期刊《mSystems》（影响因子：6.496）【派森诺项目文章】MGWAS再显神通，揭示白痢病鸡肠道菌群的遗传力！（点击查看）。最近，派森诺与孟教授团队继续合作，再次在《mSystems》发表论文，报道了家禽在进化过程中，肠道微生物组与宿主遗传物质之间复杂的互作关系，为“共生总

近日，派森诺生物与华东理工大学合作，在微生物基因组领域的《Applied and Environmental Microbiology》（影响因子4.813）发表新研究成果！在本研究中，从污水中分离得到了3种杀鲑气单胞菌（A. salmonicida）噬菌体，并对其生物学行为进行了研究，其中新分离得到的噬菌体vB_AsM_ZHF对A. salmonicida亚种有抑制作用。研究结果表明，该方法可能是一种替代抗生素的方法来保护鱼类免受多药A. salmonicida亚种的感染。研究背景杀鲑气单胞菌 (A.

派森诺生物与华中农业大学合作，在微生物领域 《Microorganisms》发表研究成果！本研究提供了沙门氏菌的毒力表型和基因组特征，为进一步了解肠道沙门氏菌的毒力机制提供了依据。本研究首次获得肠球菌高毒力分离株SE211完整基因组序列，并对其进行比较基因组学和系统发育分析，为进一步研究肠球菌遗传学提供了初步的认识。研究背景沙门氏菌是一种广泛存在的人畜共患病病原体，通过受感染的牲畜和家禽引起人类食物中毒，并在世界范围内造成了相当大的经济损失。沙门氏菌病例是全球细菌性食源性疾病比较常见的原因之一，沙门氏菌

派森诺与中国海洋大学合作，在《Enzyme and Microbial Technology》（影响因子：3.493）发表最新研究成果！本研究分离得到了一个抗金黄色葡萄球菌（S. aureus）的强毒噬菌体qdsa002，并表达和纯化了该噬菌体的內溶素（Lys84）及其结构域，发现Lys84对S. aureus具有较强的溶解活性，且比qdsa002具有更宽的杀菌谱，结果表明Lys84及其结构域可能是控制S. aureus及其生物膜的替代抗生素。研 究 背 景S.aureus是一种病原体，可引起广泛的急性

派森诺生物与上海交通大学携手合作，于近期在《Journal of Hazardous Materials》上发表了龙葵对 Cd 胁迫反应的解毒和耐受分子机制的研究成果。土壤重金属污染已成为世界性的环境问题。在所有重金属中，Cd因其强溶解性、流动性和毒性被广泛研究。Cd 在植物组织中很容易被吸收、运输和积累。因其无法被生物降解，在植物中会长期存在。而且由于食物链污染，对人类和动物健康也会构成潜在威胁。因此，对重金属污染（尤其是Cd）土壤进行修复治理势在必行。龙葵（Solanum nigrum L.）是一年

近期，派森诺与华中农业大学合作，再次在美国微生物协会（ASM）旗下的《Microbiology Spectrum》发表文章，通过扩增子测序和代谢组检测等手段，对两阶段固态发酵系统中微生物群落的演替进行详细研究，为调控食品发酵过程中的微生物群落，以及促进发酵食品工业的现代化奠定基础！研究背景随着新一代测序技术的快速发展，使得研究者对来自多个生态系统的复杂微生物群落的组成和动态的认识有了飞跃性的进展。关于生物或非生物因素对微生物群落的聚集和稳定性的影响已被广泛报道。然而，在自然生态系统中，微生物群落结构形成

派森诺与江苏省农业科学院合作，在海洋与淡水生物学领域的《Aquaculture》发表研究成果！本研究在大黄鱼（Larimichthys crocea）中发现噬菌体vB_VhaS_PcB-1G能有效预防(93.33%)和控制(86.67%)V. harveyi弧菌感染。噬菌体的抗菌作用表明，该菌种有可能作为一种抗菌剂用于控制大黄鱼的V. harveyi弧菌感染和水产养殖中的弧菌病。1、研究背景大黄鱼(Larimichthys crocea，LC)和黄花鱼(Larimichthys polyactis)是中

派森诺生物与河南农业大学杜向党教授团队合作，对4株新分离的具有多重耐药性和高毒力特性的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯氏菌（Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae，CRKP）进行全基因组测序研究，成果以“Correspondence”的形式顺利发表在《柳叶刀》旗下子刊《The Lancet Infectious Diseases》（影响因子：25.071）！可喜可贺！研究背景2016年，《The Lancet Infectious Diseases》曾发表一篇流行病

派森诺与中国人民解放军陆军军医大学&复旦大学携手合作，于近期在《Cellular & Molecular Immunology》上发表HIV-1 Vif通过靶向STING抑制抗病毒免疫的研究成果。研究背景HIV-1感染诱导的cGAS-STING-TBK1-IRF3信号激活先天免疫产生I型干扰素(IFN)。HIV-1非结构蛋白病毒感染因子(Vif)在HIV-1复制中是必不可少的，因为它降低了宿主限制因子APOBEC3G。然而，它是否以及如何调节宿主的免疫反应仍有待确定。研究内容Vif抑

近日，派森诺生物与福建医科大学附属协和医院李彬老师课题组合作，在微生物基因组领域的《Frontiers in Microbiology》发表研究成果！本研究针对大肠杆菌的遗传多样性和系统发育进行研究，揭示了大肠杆菌 ST1193 在中国福州和非中国地区传播的不同进化轨迹，进一步支持了在特定引入地理区域之后该谱系的全球传输和本地化谱系扩展。研究背景大肠杆菌(E.coli)是最常见的革兰氏阴性细菌性条件致病菌，它主要栖息于人类和其他温血动物的下肠道，在临床和流行病学方面都有极大的挑战。E.coli可导致多种

近期，派森诺与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心合作，在Cell Reports上发表了题为《Endothelial Wnts control mammary epithelial patterning via fibroblast signaling》的研究结果。该研究突出了内皮生态位在组织模式中的重要性，揭示了不同生态位组分协调上皮器官发生和组织稳态的交互机制。研究背景器官发生和组织稳态是由生态位中各种细胞类型的合作密切调控的，上皮细胞受到微环境中存在的一系列信号的影响，包括来自成纤维细胞和内皮细胞