microRNA命名规则

1、microRNA的介绍：

microRNA(miRNA)是一类长度约为19-25nt的内源性非编码RNA，广泛参与基因转录后调控活动，其中多数miRNA具有高度序列保守性、表达时序性和组织特异性。最近的研究表明miRNA参与各种各样的调节途径，包括发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细胞增殖和凋亡、脂肪代谢等，具有重要的基因表达调控作用。

2、pri-miRNA, pre-miRNA 和 mature miRNA的区别

1. pri-miRNA:成熟的miRNAs是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的，初级转录物称为pri-miRNA。pri-miRNA长度从几百到几千个碱基不等，带有5‘帽子和3’polyA尾巴，以及1到数个发夹径环结构。

2. pre-miRNA：pri-miRNA经剪切产生约70个碱基的miRNA前体，即pre-miRNA。pre-miRNA为单一发夹结构，5‘带有磷酸基团，3’有两个突出碱基，并带有3‘羟基。

3. mature miRNA：pre-miRNA经进一步剪切，形成长度约为22个碱基的单链成熟miRNA。

3、MiRNA的命名原则如下：
 

1. 一个系统命名包含三部分内容，即物种，microRNA类别，序号。三者间用短线连接。  物种一般用三个小写字母表示，如hsa,mmu和rno分别代表人，小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre-miRNA用mir表示，mature miRNA用miR表示。序号为一阿拉伯数字，代表microRNA发现的先后。一般而言，数字越小，发现越早。

2. 位于基因组不同部位但产生同样的mature miRNA的pre-miRNA在序号后添加短线和阿拉伯数字以示区别，如hsa-mir-7-1, hsa-mir-7-2, hsa-mir-7-3。

3. 有些pre-miRNA可以产生两个mature miRNA。对应pre-miRNA茎环结构5‘和3‘序列的mature miRNA分别加后缀-5p和-3p以示区分，如rno-miR-325-5p和rno-miR-325-3p。

4. 如果从同一个pre-miRNA成熟的两个mature miRNA的相对表达量已知，表达量高者加后缀＊，如hsa-miR-17*比hsa-miR-17表达量高。

5. 对于仅相差1－2个碱基的mature miRNA，加一个小写字母后缀以示区别，如hsa-miR-19a, hsa-miR-19b。