按照MNE进行复现出现的问题记录

使用 MNE、dSPM、sLORETA 和 eLORETA 进行源本地化

https://mne.tools/stable/auto_tutorials/inverse/30_mne_dspm_loreta.html

  1. 遇到安装库的问题:无法安装,可能是没有关闭代理

  2. ERROR:cannot import name ‘Brain’ from ‘surfer’
    更新了surfer也没用,需要安装 pysurfer

pip install pysurfer

在这里插入图片描述
需要安装pyqt

pip install pyqt5

若无法安装,解决方法:
快速安装pyqt方法

  1. 三维图窗口弹出来了一会儿,但是又消失了,接着报错
    pyqt5安装版本的问题
    重新安装
    pyqt5>=5.10,<5.14; platform_system == “Darwin”
    pyqt5>=5.10,!=5.15.2,!=5.15.3; platform_system == “Linux”
    pyqt5>=5.10,!=5.15.3; platform_system == “Windows”

  2. 最后这个sample界面无法进行交互,显示为未响应
    在这里插入图片描述

需要在pycharm右上角运行界面选择勾选 Run with python console
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

  1. mne的路径问题
    如果想要把自己的代码放到mne-pyhton外面
    在这里插入图片描述
    需要拷贝mne这个文件夹到外面,否则容易函数引用出错
    在这里插入图片描述
MNE是一种流行的Python EEG/MEG分析库,它提供了多种对EEG数据进行分段的方法。以下是一种基于MNE的EEG数据分段方法: 1. 读取EEG数据文件,可以是一种常见的格式,如EDF、BDF等。 2. 创建一个MNE的Raw对象,将EEG数据读取到这个对象中。 ``` import mne # 读取EEG数据文件 raw = mne.io.read_raw_edf('example.edf') ``` 3. 定义分段的参数,包括时间窗口大小和时间窗口之间的重叠量。 ``` import numpy as np # 定义分段参数 window_size = 5 # 时间窗口大小为5秒 overlap = 2 # 时间窗口之间的重叠量为2秒 sfreq = raw.info['sfreq'] # 获取采样频率 # 计算每个时间窗口包含的样本数 window_size_sample = int(window_size * sfreq) # 计算每个时间窗口之间的重叠量包含的样本数 overlap_sample = int(overlap * sfreq) ``` 4. 对EEG数据进行分段,得到多个数据段。 ``` # 对EEG数据进行分段 start = 0 stop = window_size_sample step = window_size_sample - overlap_sample segments = [] while stop < raw.n_times: segment, _ = raw[:, start:stop] segments.append(segment) start += step stop += step ``` 5. 对每个数据段进行预处理和分析,比如去除噪声、滤波、计算功率谱等。 ``` # 对每个数据段进行预处理和分析 for segment in segments: # 去除直流分量 segment = mne.filter.detrend(segment, type='linear') # 带通滤波 segment = mne.filter.filter_data(segment, sfreq, l_freq=1, h_freq=40) # 计算功率谱 psd, freqs = mne.time_frequency.psd_welch(segment, fmin=1, fmax=40, n_fft=256) # ... ``` 需要注意的是,在进行EEG数据分段时,我们需要根据实际应用需求和信号特性进行选择分段时间窗口大小和重叠量,同时还需要根据信号特性进行预处理和滤波等操作,以提高数据质量和准确性。
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