TM-align结果的PDB ID和链ID

在 TM-align 的结果文件中（TM-align蛋白质聚类数据格式转化-CSDN博客），8p0k_H 中的 H 通常是指 PDB链ID，也就是 pdb_strand_id。这一字段用于指代PDB结构文件中蛋白质的特定链。

• PDB ID：前四个字符 8p0k 是该蛋白质结构在 PDB 中的识别码。
• 链ID：H 是该结构中对应的链ID，通常与 mmCIF 文件中的 pdb_strand_id 对应。

pdb_strand_id 和 asym_id 的区别：

• pdb_strand_id：是历史上由 PDB 数据库定义的链标识符，用于区分同一PDB文件中不同的链（可以是多肽链或核酸链）。这是结构解析过程中最常见的链标识符。

• asym_id：是 mmCIF 格式中使用的一个标识符，表示非对称单元的标识符。它通常表示结构中的一个独立的多肽或核酸链，并用于细致描述每个非对称单元的内容。

在 TM-align 的结果中，由于其主要处理的是PDB文件，因此 8p0k_H 中的 H 是指 pdb_strand_id，而非 asym_id。