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https://www.microsoft.com/en-us/research/project/sanddance/?ranMID=46131&ranMID=46131&ranEAID=a1LgFw09t88&ranSiteID=a1LgFw09t88-2IQl7VKvor_SCq2jHxXWpA&epi=a1LgFw09t88-2IQl7VKvor_SCq2jHxXWpA&irgwc=1&OCID=AID2200057_aff_7806_1243925&tduid=%28ir__wxic1kt9ukkf62mo1npa1w23in2xtfvr0yljd6ec00%29%287806%29%281243925%29%28a1LgFw09t88-2IQl7VKvor_SCq2jHxXWpA%29%28%29&irclickid=_wxic1kt9ukkf62mo1npa1w23in2xtfvr0yljd6ec00

https://github.com/CJ-Chen/TBtools

https://github.com/ni1o1/pygeo-tutorial

https://github.com/neesjanvaneck/VOSviewer-Online

Releases · spm/spm12 · GitHub

绘科研-FigDraw 

本地绘制软件\包

Networks / Pajek

cytoscape

networkx（python包，NetworkX — NetworkX documentation）

igraph – Network analysis software（python-igraph）

Gephi - The Open Graph Viz Platform

gnuplot homepage

The Boost Graph Library - 1.78.0

SNAP: Stanford Network Analysis Project

Brain Connectivity Toolbox - File Exchange - MATLAB Central

GitHub - sandywang/GRETNA: A Graph-theoretical Network Analysis Toolkit in MATLAB

https://www.nitrc.org/projects/gretna

https://www.nitrc.org/projects/bnv/

GitHub - spm/spm12: SPM12

SPM - MATLAB Central

Download the SPM Software - Statistical Parametric Mapping

SPM12 Software - Statistical Parametric Mapping

Microsoft Visio（付费）

NVisual （付费）

复杂网络公开数据集

• Pajek（可视化工具）数据集：http://vladowiki.fmf.uni-lj.si/doku.php?id=pajek:data:index；
• Newman（复杂网络科学领域大牛）个人数据集：http://www-personal.umich.edu/~mejn/netdata/
• Stanford大学大规模网络数据集：http://snap.stanford.edu/data/
• 复旦大学网络数据集整理：http://gdm.fudan.edu.cn/GDMWiki/Wiki.jsp?page=Network%20DataSet
• KONECT数据集整理：http://konect.uni-koblenz.de/

相关资料：

复杂网络建模与分析：常用的分析与可视化工具 - 哔哩哔哩

各种复杂网络处理工具_jaywangpku的博客-CSDN博客_复杂网络工具

https://www.csdn.net/tags/MtTaMg4sMzkwMDQ3LWJsb2cO0O0O.html

复杂网络或图论的特性该用什么软件怎么求？ - 知乎

SNAP复杂网络处理平台_jaywangpku的博客-CSDN博客_snap复杂网络

[Network Analysis] 复杂网络分析总结 - Poll的笔记 - 博客园