生信曲线笔记

最新推荐文章于 2023-12-20 00:21:43 发布
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分类专栏： pytorch
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Tensor初始化占用内存，但是需要赋值以后放到模型中，因为这样初始化的Tensor可能会无穷大或者无穷小，

 

对矩阵维度的处理

 

 

 

 

 

三个冒号在一个维度，第三个是步长，默认是【0：28：1】

 

View reshape 在维度变换方面功能是一样的，但是要记住变换后的维度在不知道原先的维度的情况下没有办法还原。
 
维度折叠与扩展
 
 
 
维度变换要注意是否造成数据污染，同样的维度不同的位置，也会有问题
 
 
 
 
 
 
loss的梯度
 
 
 
 
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如何画多个曲线_生信代码：生存曲线绘制！
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01-12 3065
↑↑↑ 关注选刊说 ↑↑↑您的SCI选刊助手！引言： 生存分析是临床上较为常用的统计学方法，用于比较不同组别的患者在接受干预之后，生存时间的变化情况。生存分析是医学领域中一个重要的内容，在各个疾病领域的研究中都运用十分广泛。在R中进行生存分析常用的包主要有survival包以及survminer包。•Survival 包提供了生存函数的建立，Cox模型的建立，以及比较分析...
学习笔记18：ROC曲线和AUC值
Softdiamonds的博客
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TensorFlow学习笔记第一讲
xjw的博客
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tensorflow学习笔记（3）梯度下降法进行曲线拟合和线性回归
满城风絮
12-27 6162
参考： https://www.tensorflow.org/get_started/get_started http://jorditorres.org/research-teaching/tensorflow/first-contact-with-tensorflow-book/first-contact-with-tensorflow/#cap1
数据分析图表解读——生信part
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https://jingyan.baidu.com/article/0964eca212f6a88284f53675.html 16SRNAV3-V4测序效果最佳 1.柱状图 横坐标：各样本，一个条形图代表一个样本；纵坐标：各分类层级（界门纲目科属种）的序列数目或者百分比，不同颜色表示不同层级，序列只计入分类得出的最低层级。 2韦恩图 一般只能表示五个样本或者分组 3.稀释曲线...
【生信】QTL定位与全基因组关联分析(GWAS)
qq_65680034的博客
12-20 6613
上面的QQ-plot中，X轴表示期望-Log10(p-value)（值越大，说明p-value越小，即越显著），Y轴表示观测的-Log10(p-value)，由上图可以看出，在p-value较小时，观测p值和期望p值比较一致，，表型呈非连续变异，而遗传物质的数量呈潜在的连续变异的性状，即只有超过某一遗传阈值时才出现的性状，如动植物包括人类的抗病力、死亡率以及单胎动物的产仔数等性状，称为阈性状（threshold character或threshold trait）植物上，模式植物抗逆性基因的定位较多。
tidymodels绘制校准曲线
医学和生信笔记的博客
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本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 很多人都开始用tidymodels了，但是很多人还没意识到，tidymodels目前还不支持一键绘制校准曲线！相同类型的mlr3也是不支持的，都说在开发中！开发了1年多了，还没开发好！ 大家可以去项目的github相关的issue里面留言，引起开发者重视。。。 总的来说，在临床预测模型这个领域，目前还是一些
生存资料决策曲线分析DCA
医学和生信笔记的博客
09-08 5605
本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 前面介绍了logistic回归的DCA的5种绘制方法，今天学习下cox回归的DCA绘制方法。也是有多种方法可以实现，但我比较推荐能返回数据，用ggplot2自己画的那种。 生存资料的DCA方法1方法2方法3方法4 生存资料的DCA 方法1 使用dcurves包,使用的数据集是包自带的df_surv数据集，一
如何利用sklearn中roc_curve 三行代码画ROC曲线
XH生信和机器学习空间
04-10 4302
ROC曲线是评估模型效果的重要工具，其X轴为假阳性率，Y轴为真阳性率（也叫召回率recall），其意义在于，在真阳性率时，模型同时判错阳性的样本比例，因此曲线越陡，越表示模型效果好。ROC曲线下AUC面积越大表示模型效果越好，我们可以利用sklearn 中的roc_curve函数方便的画ROC曲线。 #导入要用到的库 # load the package import numpy as np im...
简明教程 | 用 PPT 做卡通热图 - eFP Graph?!
abai0410的博客
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非线性拟合之干物质降解率
weixin_42480153的博客
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评估饲料降解的公式是0rskov and McDonald (1979)提出来的，公式是 dp= a + b (1- e ^(-kd*t)) where dp,a, b,kd were the ruminal disappearance at time t, the rapidly soluble fraction, the potentially degradable fraction, the constant rate of potentially degradable fraction 本人用
细胞轨迹（trajectory）分析——Monocle
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基于微信小程序的考研资料分享系统的设计与实现.docx
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豆瓣读书书评爬虫软件将辅助你爬取你感兴趣的书目短评，交互简单，你可以轻松的获取目标书目的指定页数的内容，你可以非常方便地使用该资源即可爬取对应书目的短评内容，可以爬取指定页数的信息，也可以将内容保存到数据库sqlite中，当然也会保存为文本文件，每条评论独占一行，如果后续你要做评论的文本情感分析也会特别方便，如若不会使用，详细使用方式可以看我写的一篇文章，链接在此处，点击可跳转:https://blog.csdn.net/weixin_45938063/article/details/141500999spm=1001.2014.3001.5501 ,该资源收取1积分即可下载，欢迎支持下载，您的支持是我创作的动力
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基于企业监管、食品安全、药品安全、知识产权、特种设备监管等多维数据，通过协同各类数据资源，进行数据汇集、治理，构建支撑XX市XX区市场监管数字化平台的标准化数据库，促进XX市XX区市场监管体系的放管服改革工作，逐步实现XX市XX区全方位、全覆盖、全领域、全过程的一体化数智监管体系。
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