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转载 WGCNA如何从module中挖掘关键基因

https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/83747196认识到与表型数据相关的modules之后,还可以在modules中进一步筛选基因,为了方便筛选,对于每个基因定义了以下三个统计量。1.connectivity连接度,在之前的文章中,简单提过这个概念,类似于网络中节点的degree的概念,只不过在加权共表达网络中,由...

2019-12-30 20:52:41 1813

原创 解决samtools: /lib64/libz.so.1: version `ZLIB_1.2.3.3' not found (required by samtools)的问题

http://zlib.net/先去zlib官网去下载源码,下载安装./configuremakemake install DESTDIR=/home/my_name prefix=/softwareDESTIDIR&prefix用来安装在自己的文件夹下面的变量之后找到libz.so.1,直接使用 LD_PRELOAD偷梁换柱即可这里有一个小点注意第一次使用 L...

2019-12-14 23:46:47 2572

原创 解决类似/usr/lib64/libstdc++.so.6: version 'GLIBCXX_3.4.19' not found错误

知识盲点:find命令的灵活使用系统环境变量的了解非root权限解决/usr/lib64/libstdc++.so.6: version过低问题LD_PRELOAD的偷梁换柱之能解决类似/usr/lib64/libstdc++.so.6: version ‘GLIBCXX_3.4.19’ not found错误之前写过一篇文章https://blog.csdn.net/qq_392...

2019-12-13 15:11:21 215

原创 关于多重假设检验的总结

多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正多重假设检验与校正、BH校正FDR 和 q-valueFDR-P值是什么东西总结起来就是pvalue是一切的基础,在做校正的时候qvalue,可以由常用的三个方法分别是Bonferroni校正,BH校正和FDR校正得到。Bonferroni校正非常严厉,直接在==pvalue的基础上除以n(比较次数)==差异基因得不到或者很少。BH校正...

2019-12-10 21:34:34 1221

转载 解决/usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.8' not found一类的问题

首先如果您是root账户,您只需轻轻的升级一下gcc就好了,否则,嗨嗨嗨上正菜无root账户安装gcc,我直接安装的是最新版,可以从清华的免费镜像来下载。#没有root权限如何安装gcc到用户目录,这里是gcc-9.2.0wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/gnu/gcc/gcc-9.2.0/gcc-9.2.0.tar.gz#解压ta...

2019-12-10 21:09:46 1521

转载 富集分析集锦

链接:https://www.jianshu.com/p/988d90484f77不管是转录组,还是芯片数据,或者其他有关基因的组学分析,每当数据分析到后面,要想得到结果,都躲不过这个富集分析,因为它是帮助我们从庞杂的组学数据中发掘规律重要的一环,对基因功能进行富集分析,就有可能发现在生物学过程中起关键作用的生物通路,并且帮助理解生物学过程的分子机制。现在的高通量测序带来的巨大数据量,让我们眼...

2019-12-10 21:03:13 2656

原创 NCBI下载链接出错

SRA浏览器查询的下载链接Runinfo的下载链接使用IDM批量下载的时候,使用Runinfo的下载链接死活都找不到。虽然下载链接多数都在尾部是".1",但是下载链接并不一定一定含有它才能找到文件,这只不过是提供排查的方法。...

2019-12-05 08:52:47 510

转载 windows桌面图标显示不正常

http://www.xitongzhijia.net/xtjc/20190409/153615.html原因是因为图标是放在缓存里面的,每一次都是从缓存读取的1.查看隐藏文件2.win+r输入%localappdata%之后,删除iconcache.db3.在任务管理器后台重新启动服务即可...

2019-12-04 00:31:58 231

原创 pycharm更改项目名称

https://jingyan.baidu.com/article/d3b74d643374d31f77e60931.html我按照这篇提示操作提醒我java错误于是我把==.idea==文件删除直接重新导入工程

2019-12-03 23:03:14 2717

空空如也

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