cellranger安装

最新推荐文章于 2024-11-20 18:34:10 发布

虽迟但到

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文章标签：随笔

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_41493990/article/details/81457277

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本文档详细介绍了如何通过conda来安装cellranger。首先从anaconda官网下载Anaconda2-5.2.0-Linux-x86_64.sh，赋予执行权限并进行安装。接着创建一个名为test的环境，激活此环境，并设置conda的国内镜像源为TUNA。通过conda搜索和安装R，然后在R环境中加载biocLite镜像并安装cellranger。

摘要由CSDN通过智能技术生成

1.https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda2-5.2.0-Linux-x86_64.sh ###下载ananconda2.7版本

2.chmon +x Anaconda2-5.2.0-Linux-x86_64.sh ###赋予anaconda包可以执行权限

3../Anaconda2-5.2.0-Linux-x86_64.sh ###执行开始安装根据提示操作基本都是回车选择默认就好了

4.which conda ### 安装完之后确认一下conda安装完成

5.conda create –name test ###创建一个 test的测试环境
6.source activate test ####激活test环境命令行前端会看到（test） //具体conda的使用方法可以查看https://blog.csdn.net/qq_41493990/article/details/81331891 作为参考

7.设置国内镜像## 添加Anaconda的TUNA镜像

conda config –add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config –add channels conda-forge
8.conda config –set show_channel_urls yes ###设置搜索时显示通道地址
9.con