自动化机器学习（TPOT优化临床试验数据）

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自动化机器学习（TPOT优化临床试验数据）

1. 引言

在当今医疗和生物统计领域，临床试验数据的分析对评估新疗法的有效性与安全性具有重要意义。传统的数据预处理与模型构建往往需要大量人力和经验，而自动化机器学习（AutoML）技术则能够自动化这一流程，显著提高数据科学家的工作效率。TPOT（Tree-based Pipeline Optimization Tool）作为AutoML的代表工具，利用遗传编程自动搜索最优模型和数据预处理管道，为构建高性能预测模型提供了有力支持。

本项目旨在通过TPOT对模拟生成的临床试验数据进行自动化机器学习优化。项目中，我们将生成大规模临床试验数据，数据集包含患者基本信息、分组、基线指标、治疗响应及临床结果等字段。接着，利用TPOT自动构建并优化预测模型，比较治疗组与对照组的治疗效果。同时，为了提高大规模数据处理效率，项目中部分数值计算任务调用了GPU加速（利用cupy库）。此外，我们将Dash仪表盘与传统GUI相结合，通过Dash构建交互式仪表盘并嵌入到GUI中，实现数据加载、模型训练和结果展示的实时更新。

在本文中，我们将详细介绍以下内容：

• 临床试验数据的生成与介绍，以及数据预处理方法；
• 自动化机器学习与TPOT的基本原理与优势；
• TPOT在模型管道搜索和参数调优中的应用示例；
• GPU加速技术在大规模数据处理中的应用；
• 如何使用Dash构建交互式仪表盘，并将其嵌入到GUI中实现混合展示；
• 完整的Python代码实现