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原创 在TCGA上下载数据并且进行处理
浏览器搜索TCGA GDC进入网站在TCGA数据库主页选择“Repository”模式根据所需要的选项在侧边栏选择数据清空购物车!!第一次登陆可忽略将刚刚选择好的数据加入购物车,并且在购物车里下载Metadata和Cart数据,下载到同一个文件夹下。使用R语言脚本对数据进行处理,将其提取为gene symbol和样本的数据,推荐看一下该博主处理数据!!真的非常详细!他R语言脚本在这个链接里
2023-12-28 13:25:26
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原创 查看GEO中GSE数据的更多标签
过滤一些冗余信息(但也有可能是有用信息),最后查看所需要的分类统计。a. 无法直接下载GEOquery,使用这3句代码进行下载。通过GSE序号下载并且查看数据。
2023-12-26 22:16:57
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空空如也
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