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真阳性假阳性假阴性分割可视化
分割掩码转化为图像格式时会在分割边界处有很多灰度像素点,这将导致后续利用分割掩码和预测分割掩码进行处理时会在边界处出现很多噪声点,因此利用阈值将分割掩码转换为二值图,消除边界上的灰度像素点。原创 2023-06-14 23:13:07 · 324 阅读 · 0 评论 -
Endnote下载安装及使用
Endnote是一款文献管理软件,通过该软件可以管理汇总我们阅读的文献资料,最重要的是方便再写论文时通过此软件将参考文献以某种要求的格式插入到论文中,在许多博客中都是通过网盘下载或者官网下载安装,且破解方法实现困难或者实现不了,下面分享一个免费的endnote软件下载安装方法。原创 2023-05-29 21:18:05 · 802 阅读 · 2 评论 -
在原始图像上可视化分割结果2
之前分享的在原始图像上可视化分割结果的博客代码有一定的冗余性和局限性,即将预测分割可视化到原始图像上和将Ground_truth可视化到分割结果上由两端代码构成,且对可视化的分割线条不能改变其线条的粗细,由此重新分享一段代码,通过修改原始图像路径和分割掩码路径,即可将两个分割结果可视化在原始图像上,而且可以通过修改参数对线条的粗细进行改变。原创 2023-05-22 20:29:05 · 228 阅读 · 0 评论 -
在原始图像上可视化分割结果
将Ground truth的分割掩码与原始图像融合,从而在原始图像中可视化Ground truth的分割掩码,用绿色表示分割。训练的得分最高的模型参数文件为best_score_ISIC2018_checkpoint.pth.tar。定义一个转换图像,通过调用模型文件和训练的参数文件进行对单个输入图像进行推理预测。并将分割结果保存显示。将推理预测的分割掩码与原始图像融合,从而在原始图像中可视化预测分割,用红色表示预测分割。原创 2023-05-16 21:34:18 · 614 阅读 · 0 评论 -
批量更改文件后缀名
代码以label文件夹下的npy后缀为例,将label文件夹下的所有.npy文件的后缀名改为_seg.npy。同理,通过该段代码也可以批量将图片文件格式进行转换,例如JPG转PNG等。原创 2023-05-11 09:33:42 · 79 阅读 · 0 评论 -
ISIC数据集格式转换为NPY
本文实现的功能是将数据集的格式转换为.npy文件,代码以ISIC2018皮肤病变分割数据集为例,将原始数据尺寸resize成342x256,并将其图像.jpg格式文件和标签.png格式文件转换为.npy格式进行储存。进行数据格式转换前只需要修改原始数据的路径和转换后的.npy文件的保存路径。本文的原始ISIC2018训练集的路径为./ISIC2018_train下面image文件夹是训练图像,label文件夹是标签图像。原创 2023-05-09 17:14:14 · 683 阅读 · 0 评论 -
五折交叉验证划分数据集为训练集和验证集
五折交叉验证用于数据量比较少的模型训练,本文通过给定训练集的数据路径将训练集划分为五个文件夹folder1,folder2,folder3,folder4,folder5,并在每个文件夹下创建一个包含训练图像和验证图像名称的文件列表。运行代码前只需更改数据路径和数据后缀即可,划分的数据集在该python文件的路径下。原创 2023-05-08 21:07:21 · 1276 阅读 · 0 评论