网页版eggnog进行功能注释

最新推荐文章于 2025-02-25 15:21:14 发布
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版权
文章讲述了如何使用eggnog的网页版进行基因蛋白序列分析，用户已准备了最长转录本的fasta文件并成功上传，完成了邮箱验证，等待接收注释文件的结果。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

这次先更新网页版的eggnog，下次再更软件版

准备好基因的蛋白序列，已经提取了最长转录本的fasta文件

 打开eggnog的网址 http://eggnog6.embl.de/#/app/emapper

 上传文件，填好邮箱

 收到邮件

 

 

 

 结果文件里的注释文件

 

GO注释背景信息获取（eggNOG-mapper+TBtools eggnog-mapper helper）
qq_42639688的博客
04-28 2551
对应的是PFAM结构域注释，注意，这个注释结果是定性的，即有无某结构域，如果一个序列有多个相同结构域，只会显示一个​。，对应的是KEGG注释结果，可直接用于 TBtools KEGG富集分析，当背景注释文件​。，对应的是GO注释结果，，对应的功能文本描述​。
列注释_使用eggnog-mapper进行功能注释
weixin_42121272的博客
12-30 1013
欢迎关注微信公众号"生信小王子"！对于许多做非模式生物的同学来说，没有现成的功能注释可用是非常难受的一件事。而blast2go虽然可以一步到位帮你完成功能注释，但它是收费的。这时，我们可以使用eggnog-mapper进行功能注释。eggnog-mapper现在已经更新到了V2版本，需要在Python2.7环境下运行，并保证有超过40G的存储空间存放数据库。## 下载eggnog-mapper V...
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xuzhougeng blog
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