16s基因全长测序
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SHANGHAILINGEN
这个作者很懒,什么都没留下…
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NBT新技术震撼来袭,一张切片揭示空间宿主-微生物组互作
SHM-seq作为一种全新的技术,具有很大的潜力和发展空间。未来可以通过进一步优化实验条件和技术参数,提高SHM-seq的灵敏度和特异性,并探索SHM-seq在其他生物样本中的应用。原创 2024-04-11 09:59:34 · 363 阅读 · 0 评论 -
凌恩生物资讯|宏基因组到底要不要去宿主?
评估去除宿主DNA的宏基因组测序对微生物组的有效性原创 2023-02-27 09:47:52 · 407 阅读 · 0 评论 -
凌恩生物资讯|抗性宏基因组又一力作|抗性基因+可移动元件研究新成果!
研究其对生物脱氮性能、微生物群落结构、抗生素耐药基因(ARGs)和可移动遗传元件(MGEs)的影响。原创 2023-02-24 11:43:23 · 447 阅读 · 1 评论 -
EVAtlas:人类细胞外囊泡中ncRNA表达的综合数据库
对ncRNA在EV中的分布进行全面调查,有助于了解EV的分子特征并揭示其中的潜在作用。原创 2023-02-01 14:00:52 · 126 阅读 · 0 评论 -
科研快报 | 三代测序技术-海水微生物态,助力海水微生态及微生物基因组研究
通过三代测序对来自地中海的冬季混合海水样本进行宏基因组测序。利用PacBio Sequel II平台的超长读长明显可以提升宏基因组的组装质量,又能显著提升MAGs质量。原创 2023-01-31 09:34:31 · 275 阅读 · 0 评论 -
微刊:做了很多的16S三代测序,文章可以这样写~
凌恩生物全面升级 PacBio Sequel lle 平台,旨在搭建国内一流的组学三代测序数据生产及数据运算中心,为广大科研用户提供优质的三代测序数据及科研服务。原创 2023-01-30 10:01:54 · 473 阅读 · 0 评论 -
科研快报|Cells最新研究报道:三代全长16S测序探究银屑病患者与健康人群血浆EVs微生物组成差别
本文深度报道了中度至重度银屑病(PSOs)患者和健康对照组(HCs)之间血浆源性细胞外囊泡(EVs)中细菌群落的差异。原创 2023-01-29 11:18:00 · 135 阅读 · 0 评论 -
科研快报|二代加三代扩增子测序探究苏铁植物根部复杂微生物群落组成
利用PacBio三代测序技术,开展全长16S测序原创 2023-01-19 09:51:36 · 1580 阅读 · 0 评论 -
凌恩生物报告升级,科研美图助力群落互作机制研究
通过16S V4-V5区扩增子测序,揭示了顶端捕食者干扰水产养殖系统中浮游细菌群落的反应机制,各位老师请注意关注文章图片哦。原创 2023-01-18 11:18:29 · 515 阅读 · 0 评论 -
精要速览 | PacBio三代全长扩增子测序的多方向研究应用进展
为大家分享多篇基于PacBio三代测序平台开展的全长扩增子研究应用,让我们一起深入了解三代测序技术为微生态研究提供的新方法和新思路!原创 2023-01-17 09:49:21 · 819 阅读 · 0 评论 -
高分综述:人类肠道病毒组分类的进展和挑战
本综述总结了最近可用的四个人类肠道病毒组数据库,并讨论了它们的特征、构建过程和挑战,旨在为研究人员在选择数据库时提供参考。本综述还提出了对病毒种群进行分类的“最佳实践”。原创 2023-01-09 09:05:32 · 534 阅读 · 0 评论 -
全长扩增子医学版新增内容来啦(二)
Source Tracker溯源分析、微生物与代谢组学的关联分析原创 2023-01-04 09:09:22 · 217 阅读 · 1 评论 -
全长扩增子医学版新增内容来啦(一)
肠型分析、候选病原菌鉴定分布状态分析原创 2023-01-03 09:06:23 · 332 阅读 · 0 评论 -
DNA甲基化重编程为红梨中光诱导的花青素生物合成提供了见解
本研究阐述了光诱导下梨果皮中DNA甲基化和基因表达的变化以及两者之间的相关性,这些结果为光诱导花青素生物合成中DNA的甲基化机制提供了新的见解。原创 2022-12-30 11:25:36 · 691 阅读 · 0 评论 -
数据库 | MitoPhen 数据库:基于人体表型进行线粒体 DNA 疾病诊断
MitoPhen数据库收集和纳入的HPO词条,为mtDNA疾病的诊断提供了一个公开可用的参考数据库。原创 2022-12-29 13:39:56 · 328 阅读 · 0 评论 -
重磅综述|Nat Rev Gastroenterol Hepatol:人类胃肠道中的产甲烷古菌
古菌可能与甲烷阳性SIBO或IMO、便秘相关疾病以及CRC有较高的相关性。原创 2022-12-28 13:49:20 · 941 阅读 · 0 评论 -
16S全长测序解密转基因玉米根瘤菌群落组成
利用PacBio测序平台对根际微生物进行测序,旨在解码转基因玉米与根际微生物的相互作用和潜在的生态危害。原创 2022-12-27 10:59:32 · 720 阅读 · 0 评论 -
黄海冷水区微生物群落的季节演替及温度响应模式
为了解温度干扰下的微生物群落的变化模式提供了重要的见解原创 2022-12-26 11:00:23 · 526 阅读 · 0 评论 -
植物激素基因高级分析来啦~
植物激素基因高级分析来啦原创 2022-12-23 10:38:43 · 915 阅读 · 0 评论 -
MicFunPred——最新16S rRNA扩增子数据功能预测数据库
一款综合性的16S rRNA扩增子数据功能预测数据库——MicFunPred原创 2022-12-22 11:37:13 · 751 阅读 · 0 评论 -
比较叶绿体基因组提供海草适应性进化新见解
本研究对三个鳗草属海草的叶绿体基因组(cpGenomes)进行测序,分析、比较三者基因组结构和序列变异原创 2022-12-21 09:43:35 · 708 阅读 · 0 评论 -
生态类型 or 生境类型?16S全长测序判断河流中细菌群落构建机理
本文的结果可以为今后水环境不同生态位微生物群落的研究中选择生态类型还是生境类型作为样本区分的标准提供理论指导。原创 2022-12-20 11:47:32 · 454 阅读 · 0 评论 -
【无标题】
氨基酸的利用是影响肠道微生物分布的决定性因素。原创 2022-12-19 15:19:50 · 559 阅读 · 0 评论 -
极地土活性层和永久冻土的比较宏基因组学
基因功能研究进一步表明,来自ALs的微生物群落倾向于含有更多与甲烷/氨氧化、CSP和TCS相关的基因。原创 2022-12-16 14:43:36 · 451 阅读 · 0 评论 -
数据库 | AMDB:动物肠道微生物群落数据库
AMDB将帮助科学家通过用户友好的界面快速获取动物肠道微生物数据,将有助于更好地了解动物的肠道微生物群。原创 2022-12-15 12:58:31 · 362 阅读 · 0 评论 -
16S rRNA全长测序揭示中国重度污染河口细菌群落的时空动态
本研究采用16s全长测序对辽河口细菌群落结构进行了研究,按照四个维度进行分析。原创 2022-12-13 10:32:20 · 448 阅读 · 0 评论 -
利用全长转录组多重阵列测序检测同源异构体
MAS-ISO-seq 是一种程序化串联cDNA并进行长读段测序的单分子技术原创 2022-12-12 15:51:09 · 548 阅读 · 0 评论 -
凌恩客户文章|JCR 一区:多组学联合分析揭示PCOS真元凶
肠道细菌,肠道真菌及其相互作用可能在多囊症的发生发展中起到重要作用原创 2022-12-09 14:55:08 · 779 阅读 · 0 评论 -
三代全长16s助攻,轻松搞定水体研究领域10+文章
着三代测序势必成为取代二代测序,提升研究品质的必经之选原创 2022-12-08 10:08:44 · 479 阅读 · 0 评论 -
HIFI测序揭示拟南芥MSH1参与介导的细胞器基因组重组与变异积累规律
通过高精度的长读长测序(PacBio HiFi)解释了拟南芥MSH1参与介导的细胞器基因组重组与变异积累规律原创 2022-12-07 09:33:14 · 354 阅读 · 0 评论 -
PacBio HiFi 测序动植物基因组项目真实案例测评
为大家带来HiFi测序在实战中的数据测评原创 2022-12-06 09:43:01 · 674 阅读 · 0 评论 -
16S全长测序揭示绿头虻肠道微生物及共生细菌
通过PacBio 16S rRNA基因全长测序进一步确定其肠道微生物群落的物种多样性原创 2022-12-05 09:24:51 · 415 阅读 · 0 评论 -
LotuS2:新一代扩增子数据分析神器(更快、更准、更稳定)
Microbiome发表了一种新的扩增子数据处理神器——LotuS2原创 2022-12-02 10:06:48 · 328 阅读 · 0 评论 -
数据库 | ATACdb:一个全面的人类染色质可开放性数据库
本研究开发了一个全面的人类染色质可开放性数据库(ATACdb),可以帮助研究人员深入理解表观基因组机制,并在可开放染色质区域发现更多的生物功能原创 2022-12-01 09:43:28 · 547 阅读 · 0 评论 -
利用综合微生物指数评估富营养化危险沿海湿地生态状况
揭示了湿地生态系统对主导压力因子的变化特征;确定压力因子对滨海潮滩湿地生态系统的作用途径。原创 2022-11-30 09:59:34 · 424 阅读 · 0 评论 -
Hifiasm-meta | 你没看错!基于宏基因组的完成图!!
hifiasm-meta软件将进一步推动宏基因组组装原创 2022-11-29 09:52:58 · 391 阅读 · 0 评论 -
加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二)
加量不加价!扩增子新版分析流程结果解读(二)原创 2022-11-28 10:17:47 · 430 阅读 · 0 评论 -
PacBio三代全长扩增子测序对珊瑚共生虫黄藻和细菌群落进行精确分类
利用PacBio全长16S rRNA和ITS测序,调查常见印度-太平洋珊瑚样本之间的共生微生物,首次完整的调查了泰国湾相关的藻类和细菌群落的结构及多样性原创 2022-11-17 09:22:51 · 296 阅读 · 0 评论 -
数据库 | VirusCircBase:环状 RNA病毒数据库
功能富集分析表明,来自dsDNA病毒的病毒circRNA参与了与癌症相关的KEGG通路。原创 2022-11-15 10:03:53 · 500 阅读 · 0 评论 -
凌恩客户文章|Nature子刊-水体RNA宏病毒组
从长江入海口附近洋山深水港水域采集10升水,富集得到病毒样颗粒,提取病毒核酸,分别构建DNA和RNA病毒测序文库,进行illumina测序原创 2022-11-14 09:18:38 · 206 阅读 · 0 评论