《网易云课堂,腾讯课堂生信讲师——阿宁生信》
library(RCircos)
#导入内建人类染色体数据
data(UCSC.HG38.Human.CytoBandIdeogram)
cyto.info <- UCSC.HG38.Human.CytoBandIdeogram
RCircos.Set.Core.Components(cyto.info, chr.exclude=NULL,tracks.inside=10, tracks.outside=0 )
#chr.exclude <- NULL; 设置不显示的染色体,如 c(1,3)
#cyto.info <- UCSC.HG19.Human.CytoBandIdeogram; 设置染色体数据
#tracks.inside <- 10; 设置内部track 个数
#tracks.outside <- 0; 设置外部track 个数
#设置外部track 个数
RCircos.Set.Plot.Area()
RCircos.Chromosome.Ideogram.Plot() #绘制染色体表意文字,染色体的默认方法亮点和染色体名称