病理图像处理
病理图像处理工具介绍;病理组学特征提取
SongGu1996
放射影像分析、病理图像分析、深度学习(分类任务;ROI分割;图像超分;风格迁移)、机器学习(特征工程)
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Win11安装OpenSlide(Python + MATLAB R2022a)
Window11下安装OpenSlide工具,包括了Python和MATLAB R2022a下的安装步骤原创 2022-07-05 22:56:58 · 1543 阅读 · 0 评论 -
细胞形态特征(Matlab实现)
本文的目的是根据细胞的分割图像定义一些特征用于定量地描述细胞形态,使用的编程工具为Matlab 2018b。本文中使用例子为TCGA细胞分割数据集中的一张,原始图像(尺寸为1000×1000)如下左,相应的细胞分割图(二值图)如下右,计算细胞形态学特征使用的是右边的细胞分割图,原始图像不参与计算。具体方法为:先对二值化后的细胞分割图寻找连通域,每个连通域都视作一个细胞,计算每个连通域的......原创 2019-08-09 13:13:06 · 2349 阅读 · 0 评论 -
细胞空间结构特征之-德劳内三角形特征(Matlab实现)
本文目的是根据细胞中心点的德劳内三角形图计算一些统计量,定量地描述细胞的空间结构特征,使用的软件为Matlab 2018b。德劳内三角形(Delaunay)的定义和特点这里不再赘述,有兴趣钻研的小伙伴请自行百度。本文中使用例子为TCGA细胞分割数据集中的一张,原始图像(尺寸为1000×1000)如下左,相应的细胞分割图(二值图)如下右,计算德劳内三角形使用的是右边的细胞分割图,原始图像不参与计......原创 2019-08-22 14:28:52 · 1283 阅读 · 12 评论 -
细胞空间结构特征之-细胞集群特征(Matlab实现)
本文的目的是根据细胞的分割图像计算一些特征用于描述细胞的集群情况,细胞集群特征是细胞空间结构特征的一种,使用的编程工具为Matlab 2018b。本文中使用例子为TCGA细胞分割数据集中的一张,原始图像(尺寸为1000×1000)如下左,相应的细胞分割图(二值图)如下右,计算细胞集群特征使用的是右边的细胞分割图,原始图像不参与计算。首先根据细胞分割图计算一些提取细胞集群特征需要用到的......原创 2019-10-06 10:28:52 · 1059 阅读 · 2 评论