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原创 gromacs蛋白质-配体复合物(tutorial 5)-初学-模拟流程记录

gromacs教程5,一步步跟着来,一定能跑!

2024-09-07 21:29:00 1240 3

原创 gromacs溶菌酶-初学-模拟流程记录

研0老师想开一个新方向,但是不怎么了解分子模拟,所以只能艰难摸索,为了防止之后忘记,于是就将练习过程,遇到的问题以及解决办法都记下来。直接百度pdb,进入数据库,搜索1AKI即可,在页面右上角download files下选择PDB Format(我是win10)这一步我是直接在txt文档中打开1AKI的pdb文件,删除文件中所有HOH残基所在行gmx pdb2gmx -f 1AKI.pdb -o 1AKI_processed.gro -water spce输入15,回车,得到如下显示。这个按照官网给的教程

2024-08-23 23:49:21 1022 1

空空如也

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