TCGA-Assembler工具下载数据

TCGA-Assembler是一款用于下载和预处理TCGA癌症基因数据的工具。该软件可以方便地获取RNA-Seq基因表达和DNA拷贝数数据,并进行初步的质量控制和数据整合,便于后续的差异表达分析、共表达网络构建和生存分析等研究。
摘要由CSDN通过智能技术生成
美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,TCGA)计划,试图通过应用基因组分析技术,特别是采用大规模的基因组测序,将人类全部癌症(近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤)的基因组变异图谱绘制出来,并进行系统分析,旨在找到所有致癌和抑癌基因的微小变异,了解癌细胞发生、发展的机制,在此基础上取得新的诊断和治疗方法,最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。
TCGA 使命:提高人们对癌症发病分子基础的科学认识及提高我们诊断、治疗和预防癌症的能力

TCGA 目标:完成一套完整的与所有癌症基因组改变相关的“图谱”。




TCGA数据源大部分都是公开的,如何有效的进行收集和预处理是一个

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