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BWA:https://www.cnblogs.com/zkkaka/p/6146214.htmlSamtools:https://www.plob.org/article/7112.html 

2018-09-09 00:51:45 1460

转载 [转]awk详解

生信分析过程中经常需要对文件进行简单的数据分析,可以用awk命令解决。生信应用一:通过Kmer.freq文件粗略估计基因组大小Kmer.freq文件第一列为Kmer的深度,第二列为该深度下Kmer的种类数,第三列为该深度下Kmer种类数的频率,第四列为该深度下Kmer的总数=第一列*第二列基因组大小=总Kmer数/平均深度cat kmer_freq|awk -F" " '{sum+...

2018-09-01 22:02:04 156

空空如也

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