飘羽的博客

为梦而不停的奔跑

shell中使用hadoop进行结果文件的合并的命令

操作命令为: hdfs dfs -getmerge /home/blast_test/output /home/blast_test/output_merge.txt 使用方法:hadoop fs -getmerge [addnl] 接受一个源目录和一个目标文件作为输入,并且...

2017-12-16 13:34:38

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Centos6.5执行yum命令时出现:Another app is currently holding the yum lock; waiting for it to exit...

原因是: 由于其他的进程正在占用yum命令,所以进行了加锁模式。 解决办法: 1.查看当前的进程状态: #ps aux|grep yum root 25960 0.0 0.0 0 0 ? Z Sep19 0:01 [yumBackend.py] 2.kill掉当前的进程 kill 25...

2017-12-05 15:21:06

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linux的shell脚本中执行多个命令的方法

第一种是以分号(;)进行划分: 表示:各命令的执行的果,不会影响其它命令的执行。换句话说,各个命令都会执行,但不保证每个命令都执行成功。 第二种命令之间&&隔开 表示:若前面的命令执行成功,才会去执行后面的命令。这样可以保证所有的命令执行完毕后,执行过程都是成功的。 ...

2017-12-05 15:13:03

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Centos上解压文件是出现:Not found in archive

原因是参数不正确。 解决办法: 将原来的解压命令: tar -zxvf jdk-8u144-linux-x64.tar.gz  /home 改为: tar -zxvf jdk-8u144-linux-x64.tar.gz  -C /home 添加“-C”即可! ...

2017-12-05 15:08:24

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Centos6.5上搭建FTP远程yum源

1.上篇文章已经配置好的远程FTP服务器: ftp://172.24.240.160/pub 2.在客户机上配置yum源 cd /etc/yum.repos.d vi centos6.repo 添加内容为: [base] name=ce...

2017-12-05 14:58:02

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Centos6.5上搭建FTP服务

1.首先配置本地yum源: 具体步骤见之前的文章 2.通过yum源安装ftp:   yum -y install vsftpd* 3.启动vsftpd服务:  /etc/init.d/vsftpd restart 4.挂载...

2017-12-05 14:49:06

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Centos6.5下本地安装Bowtie2的详细步骤

1.现在Bowtie2安装包: bowtie2-2.3.3-linux-x86_64.zip 2.将安装包放在指定的文件目录下,并进行解压缩: unzip bowtie2-2.3.3-linux-x86_64.zip 3.配置环境变量: vi /etc/profile ...

2017-12-05 14:34:07

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Centos6.5系统下本地安装BLAST步骤

1.NCBI上下载BLAST软件安装包: ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 2.将压缩包放在自己指定的目录下,进行解压缩: tar -zxvf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 3.解压完成后,配置...

2017-12-05 14:26:06

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