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Fight Disease With Code ! Fight Disease With DT !

停止NVIDIA的GPU进程

kill -9 PID某个GPU进程:停止进程:kill -9 5694

2018-06-05 17:54:55

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CentOS7 关闭防火墙

每次远程连接Jupyter Notebook,都被禁止访问需要临时关闭防火墙。CentOS7版本防火墙默认使用firewalld#临时关闭 systemctl stop firewalld #禁止开机启动 systemctl disable firewalld Removed symlink /e...

2018-05-31 17:44:14

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设置Win可远程访问服务器jupyter notebook

首先是要 安装 Anaconda 。默认情况下,安装好 Anaconda 后打开 jupyter notebook, 访问本地 localhost:8888 即可。但是如果要访问另一台机器,比如远端服务器上的 notebook, 即默认是不支持 172.104.105.119:8888 这样的访问...

2018-05-22 20:06:15

阅读数:366

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Error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.8' not found (required by /usr/anaconda3/bin/)

###Error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.8' not found (required by /usr/anaconda3/bin/../lib/./libicui18n.so.58)###strings /usr/lib64...

2018-05-22 19:51:53

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centos7 选定默认启动内核,及删除无用内核

#使用cat /boot/grub2/grub.cfg |grep menuentry 查看系统可用内核 [root@bigapp-slave27 ~]# cat /boot/grub2/grub.cfg |grep menuentry if [ x"${feature_men...

2018-05-18 16:14:24

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RDKit:计算不同小分子构象之间的RMSD

计算两个小分子之间的RMSD,可以用来判断两个构象的接近程度。第一步:安装AnacondaWin或者Linux系统下Anaconda安装,不赘述,网上很多教程。第二步:安装RDKit通过conda安装RDKitconda install -c rdkit rdkit第三步:使用方法python i...

2018-05-17 11:48:52

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UCSF DOCK6.8对接教程之蛋白分子表面和受体空间准备

准备蛋白质分子的表面文件(Chimera) 打开rec_noH.pdb,Action>Surface>show Tools>Structure Editing>Write DMS ,保存为rec.dms 生成受体空间(DOCK6....

2018-05-17 11:27:33

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Linux 删除和替换文件中某些行的方法

删除mol2格式文件中的title

2018-05-17 11:08:29

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UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件

UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件        DOCK6 是UCSF  (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。

2017-12-28 18:26:08

阅读数:794

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ldconfig提示is not a symbolic link警告的去除方法

ldconfig提示is not a symbolic link警告的去除方法

2017-11-25 21:22:46

阅读数:164

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Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit(修正)

Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit(修正) 一、RDKit简介 Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit点击打开链接 前面写的一篇CentOS 7下安装RDkit的文章,在测试的时候有很多报错,且不支持InChI和Avalon toolkit,后...

2017-10-29 15:06:30

阅读数:1239

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Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装DOCK6.8

Linux-64位系统下,分子对接软件DOCK6.8的安装。

2017-09-10 18:16:56

阅读数:645

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Linux(64位)下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战(三)

Python调用openbabel的API输出sdf格式分子文件中的分子的分子量。

2017-08-26 23:49:36

阅读数:583

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Linux(64位)下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战(二)

多分子SDF格式分子文件分割为单个分子的sdf文件。 openbabel2.4、IPython、Python2.7

2017-08-26 23:26:51

阅读数:559

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Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装GaussView5

GaussView的介绍和Linux系统下安装GaussView5

2017-08-22 20:17:52

阅读数:2036

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PubChem分子库

PubChem介绍,及如何下载PubChem网站FTP服务器上的数据,此处下载分子库!

2017-08-13 17:27:34

阅读数:2948

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CentOS7(64位)查看CPU和NVIDIA显卡温度

centos7查看CPU和NVIDIA显卡温度

2017-07-25 20:51:57

阅读数:2814

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CentOS 7-(64位)系统下安装Anaconda(Python3.x)及pip使用

ipython2、ipython3,以及安装不同版本python程序包!

2017-07-12 22:47:44

阅读数:1780

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Linux(CentOS 7)(64位)系统下安装Pymol(1.8.6)

硬件环境

2017-06-17 18:18:25

阅读数:1923

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CentOS 7(64位)系统中安装AutoDockTools(MGLTools)

硬件环境: 获取安装包: 官网:http://mgltools.scripps.edu/downloads点击打开链接 CentOS 7(64位)系统中安装MGLTools 获取root权限;进入安装包所在文件夹;赋予权限;运行安装。 su root #获取root权限...

2017-06-11 18:35:04

阅读数:1140

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