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BioPython安装与入门

BioPython简介 Biopython工程是一个使用Python来开发计算分子生物学工具的国际团体。(http://www.python.org) Python是一种面向对象的、解释型的、灵活的语言,在计算机科学中日益流行。Python易学,语法明晰,并且能很容易的使用以C,C++或 者FO...

2018-08-31 13:09:22

阅读数:275

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初探Django2.1:Win10+Python3.6.6环境下安装Django

Django的简介 Django的是一个开放源代码的网络应用框架,由Python的写成。采用了MVC的框架模式,即模型男,视图V和控制器C.它最初是被开发来用于管理劳伦斯出版集团旗下的一些以新闻内容为主的网站的,即是CMS(内容管理系统)软件。并于2005年7月在BSD许可证下发布。这套框架是以...

2018-08-22 19:24:18

阅读数:94

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《机器学习Python实践》——数据导入(CSV)

一,CSV 逗号分隔值(逗号分隔值,CSV,有时也称为字符分隔值,因为分隔字符也可以不是逗号),其文件以纯文本形式存储表格数据(数字和文本)。字幕:纯意味着该文件的英文一个字符序列,不含必须像二进制数字那样被解读的数据。CSV文件由任意数目的记录组成,记录间以某种换行符分隔;每条记录由字段组成,...

2018-08-14 18:14:10

阅读数:116

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Jupyter Notebook显示图像

  使用matplotlib绘图 %matplotlib inline #!/usr/bin/python3 %matplotlib inline jupyter内嵌问题, %pylab inline    

2018-08-12 17:47:28

阅读数:352

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ChemDataExtractor:从PDF、HTM、文本等中提取化学数据

ChemDataExtractor简介 ChemDataExtractor是一种从科学文档中自动提取化学信息的工具。给它一篇期刊文章,它将从文本中提取化学名称、属性和光谱,以便将它们导入数据库或电子表格。 ChemDataExtractor官网 ChemDataExtractor特点 自然...

2018-08-12 17:46:29

阅读数:82

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基于Pytorch和RDKit建立QSAR模型

Pytorch与QSAR 尝试使用pytorch和RDKit构建QSAR模型   环境依赖 pip install pprint pip install argparse #安装rdkit conda install -c rdkit rdkit 安装pytorch 基于Pytorc...

2018-08-11 13:46:16

阅读数:239

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Win10+Python3.6下Pytorch安装(基于conda或pip)

Pytroch简介 Pytorch是Facebook的AI研究团队发布了一个Python工具包,专门针对GPU加速的深度神经网络(DNN)编程.Torch是一个经典的对多维矩阵数据进行操作的张量(tensor)库,在机器学习和其他数学密集型应用有广泛应用。但由于Torch语言采用Lua,导致在国...

2018-08-11 12:07:18

阅读数:292

评论数:2

CentOS7.5(64位)安装Anaconda

一、获取Linux版的Anaconda安装包1.官网点击打开链接https://www.anaconda.com/download/2.Anaconda开源镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/二、安装Anaconda1.运...

2018-05-29 18:25:40

阅读数:573

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深度学习在小分子药物研发中的应用

一、深度学习在小分子药物研发中的应用二、深度学习工具

2018-05-26 20:13:38

阅读数:446

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Windows 10下安装Anaconda(Anaconda3-5.1.0)

一、获取Win的Anaconda安装包1.官网https://www.anaconda.com/download/2.开源镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/二、安装过程1.运行安装包,点击Next;2.点击I Agree...

2018-05-25 19:18:05

阅读数:1148

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Windows 10下安装Miniconda3

一、获取win的Miniconda3安装包1.官网https://conda.io/miniconda.html2.开源镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/二、安装过程1.运行安装包,点击Next;2.点击 I Agr...

2018-05-25 17:50:05

阅读数:292

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创建独立的Python化学信息学环境

一、安装AnacondaWin或者Linux系统下Anaconda或Miniconda安装,不赘述,网上很多教程。二、创建Python3.x虚拟环境conda create -n pydd36 python=3.6 conda三、测试环境#激活虚拟环境source activate pydd36#...

2018-05-23 14:49:56

阅读数:139

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设置Win可远程访问服务器jupyter notebook

首先是要 安装 Anaconda 。默认情况下,安装好 Anaconda 后打开 jupyter notebook, 访问本地 localhost:8888 即可。但是如果要访问另一台机器,比如远端服务器上的 notebook, 即默认是不支持 172.104.105.119:8888 这样的访问...

2018-05-22 20:06:15

阅读数:378

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Error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.8' not found (required by /usr/anaconda3/bin/)

###Error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.8' not found (required by /usr/anaconda3/bin/../lib/./libicui18n.so.58)###strings /usr/lib64...

2018-05-22 19:51:53

阅读数:295

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Win或Linux系统下用conda安装Open Babel

一、安装Anaconda或Miniconda二、利用conda安装openbabelconda install -c openbabel openbabel

2018-05-17 22:54:02

阅读数:271

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