开源化学信息学库 ：ScaffoldGraph

ScaffoldGraph是一个开放源代码化学信息库，使用RDKit和NetworkX构建，用于生成和分析骨架网络和支架树。

1. 特点

• 骨架网络生成(Varin, 2011)

  通过迭代删除可用环来探索骨架空间，从而为一组输入分子生成所有可能的子骨架。输出是分子骨架的有向无环图。

• HierS网络生成（Wilkens，2005年）

  通过迭代移除可用环来探索骨架空间，生成所有可能的子骨架，而不会剖析稠密的环系统。

• 骨架树生成（Schuffenhauer，2007）

  通过从分子骨架中反复去除特征最少的环来探索骨架空间。输出是一棵分子骨架树。

• Murcko片段生成（Bemis，1996年）

  通过迭代去除可用环，为分子生成一组murcko片段。

• 化合物集富集（瓦林，2010，2011）

  从初步筛选数据中识别出活性化学系列。

 

2. 与现有软件的比较

• 骨架网络生成器（SN