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停止NVIDIA的GPU进程

kill -9 PID某个GPU进程:停止进程:kill -9 5694

2018-06-05 17:54:55

阅读数:33

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开源化学信息学工具包(Open Access Cheminformatics Toolkits)

1. CDK (Chemistry Development Kit) 官网:https://cdk.github.io/点击打开链接        CDK是结构化学信息学和生物信息学的开源Java库。 该项目由Christoph Steinbeck,Egon Willighagen与Jmol和JC...

2018-06-01 12:14:22

阅读数:245

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CentOS7 关闭防火墙

每次远程连接Jupyter Notebook,都被禁止访问需要临时关闭防火墙。CentOS7版本防火墙默认使用firewalld#临时关闭 systemctl stop firewalld #禁止开机启动 systemctl disable firewalld Removed symlink /e...

2018-05-31 17:44:14

阅读数:21

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CentOS7.5(64位)安装Anaconda

一、获取Linux版的Anaconda安装包1.官网点击打开链接https://www.anaconda.com/download/2.Anaconda开源镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/二、安装Anaconda1.运...

2018-05-29 18:25:40

阅读数:53

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深度学习在药物发现领域的兴起

摘要过去的十年中,深度学习(DeepLearning,DL)在各种人工智能研究领域取得了显着的成功。从以前对人工神经网络的研究演变而来,该技术在诸如图像和语音识别,自然语言处理等领域表现出优于其他机器学习(Machine Learning,ML)算法的性能。近年来,深度学习在医药研究中的第一波应用...

2018-05-28 17:11:18

阅读数:92

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Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装DOCK6.8

Linux-64位系统下,分子对接软件DOCK6.8的安装。

2017-09-10 18:16:56

阅读数:369

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UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件

UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件        DOCK6 是UCSF  (加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接的软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。

2017-12-28 18:26:08

阅读数:445

评论数:3

UCSF DOCK6.8对接教程之蛋白分子表面和受体空间准备

准备蛋白质分子的表面文件(Chimera) 打开rec_noH.pdb,Action>Surface>show Tools>Structure Editing>Write DMS ,保存为rec.dms 生成受体空间(DOCK6....

2018-05-17 11:27:33

阅读数:27

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CentOS 7(64位)系统中安装AutoDockTools(MGLTools)

硬件环境: 获取安装包: 官网:http://mgltools.scripps.edu/downloads点击打开链接 CentOS 7(64位)系统中安装MGLTools 获取root权限;进入安装包所在文件夹;赋予权限;运行安装。 su root #获取root权限...

2017-06-11 18:35:04

阅读数:828

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Python3学习笔记(二):基本数据类型

Python 中的变量不需要声明,每个变量在使用前都必须赋值,变量赋值以后该变量才会被创建。Python 中,变量就是变量,它没有类型,我们所说的"类型"是变量所指的内存中对象的类型。等号(=)用来给变量赋值。等号(=)运算符左边是一个变量名,等号(=)运算符右...

2018-05-29 00:03:55

阅读数:34

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Python之%s%d%f

%s 字符串string="hello" #%s打印时结果是hello print ("string=%s" % string) # output: string=hello ...

2018-05-28 15:26:39

阅读数:23

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Python3学习笔记(一):基础语法

Python 是一个高层次的结合了解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。Python 是一种解释型语言: 这意味着开发过程中没有了编译这个环节。类似于PHP和Perl语言。Python 是交互式语言: 这意味着,您可以在一个Python提示符,直接互动执行写你的程序。Python 是面向对象...

2018-05-28 15:05:51

阅读数:48

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数据挖掘与数据分析

一、数据挖掘和数据分析概述数据挖掘和数据分析都是从数据中提取一些有价值的信息,二者有很多联系,但是二者的侧重点和实现手法有所区分。 数据挖掘和数据分析的不同之处: 1、在应用工具上,数据挖掘一般要通过自己的编程来实现需要掌握编程语言;而数据分析更多的是借助现有的分析工具进行。 2、在行业知识方面,...

2018-05-28 13:58:14

阅读数:125

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Python & 机器学习之项目实践

机器学习是一项经验技能,经验越多越好。在项目建立的过程中,实践是掌握机器学习的最佳手段。在实践过程中,通过实际操作加深对分类和回归问题的每一个步骤的理解,达到学习机器学习的目的。预测模型项目模板不能只通过阅读来掌握机器学习的技能,需要进行大量的练习。本文将介绍一个通用的机器学习的项目模板,创建这个...

2018-05-28 13:26:51

阅读数:69

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药物设计的深度学习(Deep Learning for Drug Design)

 翻译《Deep Learning for Drug Design: an Artificial Intelligence Paradigm for DrugDiscovery in the Big Data Era》摘要        过去的十年中,深度学习(deeplearning, DL)方...

2018-05-27 00:58:11

阅读数:273

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深度学习在小分子药物研发中的应用

一、深度学习在小分子药物研发中的应用二、深度学习工具

2018-05-26 20:13:38

阅读数:89

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Windows 10下安装Anaconda(Anaconda3-5.1.0)

一、获取Win的Anaconda安装包1.官网https://www.anaconda.com/download/2.开源镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/二、安装过程1.运行安装包,点击Next;2.点击I Agree...

2018-05-25 19:18:05

阅读数:139

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Windows 10下安装Miniconda3

一、获取win的Miniconda3安装包1.官网https://conda.io/miniconda.html2.开源镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/二、安装过程1.运行安装包,点击Next;2.点击 I Agr...

2018-05-25 17:50:05

阅读数:29

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创建独立的Python化学信息学环境

一、安装AnacondaWin或者Linux系统下Anaconda或Miniconda安装,不赘述,网上很多教程。二、创建Python3.x虚拟环境conda create -n pydd36 python=3.6 conda三、测试环境#激活虚拟环境source activate pydd36#...

2018-05-23 14:49:56

阅读数:45

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设置Win可远程访问服务器jupyter notebook

首先是要 安装 Anaconda 。默认情况下,安装好 Anaconda 后打开 jupyter notebook, 访问本地 localhost:8888 即可。但是如果要访问另一台机器,比如远端服务器上的 notebook, 即默认是不支持 172.104.105.119:8888 这样的访问...

2018-05-22 20:06:15

阅读数:61

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