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RDKit toolkit实战二:Generating Similarity Maps Using Fingerprints

RDKit toolkit实战:Generating Similarity Maps Using Fingerprints 调用RDKit的Python API进行模仿学习。

2017-10-30 19:02:02

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Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit(修正)

Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit(修正) 一、RDKit简介 Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit点击打开链接 前面写的一篇CentOS 7下安装RDkit的文章,在测试的时候有很多报错,且不支持InChI和Avalon toolkit,后...

2017-10-29 15:06:30

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GROMACS运行参数整理(二)

Gromacs运行参数中文注释 中文注释仅供参考!!!

2017-10-29 14:21:51

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GROMACS运行参数整理(一)

Gromacs运行参数中文注释 中文注释仅供参考!!! 1.Preprocessing include = ... ; 指定拓扑结构目录 define = ... ; 预处理控制拓扑文件 -DPOSRES ; 位置限制 -DFLEXIBLE ; 柔性水代替刚性...

2017-10-23 23:57:05

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Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装Xmgrace

Xmgrace是Linux下类似origin的免费开源画图软件。

2017-10-21 16:46:38

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RDKit toolkit实战一:调用Python API

RDKit是一款开源化学信息学与机器学习工具包,提供C++和Python的API接口。 RDKit的编译安装及Python(2.7)绑定见博文:Linux(CentOS 7_x64位)系统下安装RDkit RDKit iPython Notebook参考网站点击打开链接 配置...

2017-10-17 22:13:33

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GROMACS运行参数之em_real.mdp文件详解

GROMACS(5.1.4)教程:蛋白质配体复合物 官网:点击打开链接 李老师博客:点击打开链接 蛋白质配体复合物模拟能量最小化过程中需要用到输入文件em_real.mdp,现对里面的各种编辑项目做简单注释。 ###em_real.mdp### ; LINES STARTING WITH...

2017-10-01 18:38:52

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GROMACS运行参数之md.mdp文件详解

GROMACS(5.1.4)教程:蛋白质配体复合物 官网:点击打开链接 李老师博客:点击打开链接 蛋白质配体复合物模拟md运行过程中需要用到输入文件md.mdp,现对里面的各种编辑项目做简单注释。 ###md.mdp### title = Protein-ligand comp...

2017-10-01 18:33:07

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GROMACS运行参数之npt.mdp文件详解

GROMACS(5.1.4)教程:蛋白质配体复合物 蛋白质配体复合物模拟npt平衡过程中需要用到输入文件npt.mdp,现对里面的各种编辑项目做简单注释。

2017-10-01 18:28:16

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GROMACS运行参数之nvt.mdp文件详解

蛋白质配体复合物模拟nvt平衡过程中需要用到输入文件nvt.mdp,现对里面的各种编辑项目做简单注释。

2017-10-01 18:18:39

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