2020年11月_ElminsterAumar

12月 11月 10月 09月 08月 05月

原创 Tensorflow2.x - Keras 导出pb模型和saved_model.pb模型

在TensorFlow 2.x的Keras中，导出pb模板的逻辑，与1.0版本有所不同。流程如下：指定模型的存储路径和名称。替换model为想要导出的模型，需要加载参数之后。模型转换操作。输出pb模型和pbtxt模型。源码如下：import tensorflow as tffrom tensorflow import kerasfrom tensorflow.python.framework.convert_to_constants import convert_variables_t

2020-11-18 16:31:11 4947

原创 Program - 图像去除周围黑色区域和获得最大内接矩形

算法的目标是这样的，目前有一批图像，是旋转矫正之后的图像，旋转之后，周围的空白，使用黑色填充。现在需要一批，矫正角度之后的图像，用于训练和预测，图像的旋转角度。因此，需要提取这些图像的最大内接矩形，去掉周围的黑色区域。原始图像：目标效果，即只截取中心区域：获取图像的高和宽h, w, _ = img_bgr.shapeimg_copy = copy.copy(img_bgr)使用洪水漫灌算法，避免周围出现一些干扰点，保证4个角的都是连通域，处理之后，Mask的四个角的值是1，其他地方是0。

2020-11-04 19:45:49 2400 1

原创 Python - 下载URL至OpenCV图像

下载图像URL的时候，经常会遇到，下载之后再读取的情况，那么，直接下载图像到内存中，转换为OpenCV的Numpy格式，即可。读取response的内容，转换为字节矩阵，再使用OpenCV解码为图像，即可。源码如下：def download_url_img(url): """ 下载url图像 """ import cv2 import requests try: response = requests.get(url, timeout=3

2020-11-04 17:55:25 803

药物设计相关数据库.xmind

药物设计相关数据库是专门收集、整理和提供药物候选分子、生物靶标信息、药物化学结构、生物活性数据以及药物设计工具的电子资源。

2024-07-02

MMseqs2最新版本可执行文件

官网源码：https://github.com/soedinglab/MMseqs2 MMseqs2 可执行文件，根据源码编译，需要安装插件运行，支持 MPI 功能。 apt-get install libatomic1 性能测试，参考文章：https://spike.blog.csdn.net/article/details/131966061 MMseq2 是非常强大和高效的生物信息学软件，可以在极短的时间内对大规模的核苷酸和蛋白质序列进行搜索和聚类。主要特点有： - 使用一种新颖的序列比对算法，可以在保持高灵敏度的同时，大幅提高搜索速度。它可以比 BLAST 快 10000 倍，比 PSI-BLAST 快 400 倍。 - 可以处理多种序列格式，包括 FASTA, FASTQ, A3M, Stockholm 等，还可以直接从 NCBI 下载序列数据，或者从 UniProt, Pfam, InterPro 等数据库中获取预构建的序列集。

2023-07-27

DrugChat测试模型

使用开源数据，未训练充分，仅用于测试。

2023-06-26

冷冻电镜的低通滤波算法

优化版本的冷冻电镜的低通滤波算法v1.1，目标，将冷冻电镜图像，通过低通滤波算法降噪，输入冷冻电镜图像，输出信息集中的降噪图像。参考文章：https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/126127817?spm=1001.2014.3001.5502

2022-08-02