HDU 1080 Human Gene Functions 动态规划 + DFS

题目大意：

匹配连个不同的DNA单链的相关度， 求相关度的值

大致思路：

由于不同的加入'-'符号的位置将会影响相关度，这里DFS搜索出当第一个串匹配到第 i 个字母 ， 第二个穿匹配到了第 j 个字母时能得到的最大相关度 dp[ i ][ j ]那么记忆化一下即可。

算是一个历史遗留下来的题，现在看到做起来比较轻松了

代码如下：

Result  :  Accepted     Memory  :  316 KB     Time  :  0 ms

/*
 * Author: Gatevin
 * Created Time:  2014/8/14 19:11:34
 * File Name: haha.cpp
 */
#include<iostream>
#include<sstream>
#include<fstream>
#include<vector>
#include<list>
#include<deque>
#include<queue>
#include<stack>
#include<map>
#include<set>
#include<bitset>
#include<algorithm>
#include<cstdio>
#include<cstdlib>
#include<cstring>
#include<cctype>
#include<cmath>
#include<ctime>
#include<iomanip>
using namespace std;
const double eps(1e-8);
typedef long long lint;

const int inf = 0x7fffffff;

int dp[101][101];
map<pair<char, char>, int> C;
char s1[101];
char s2[101];
int len1, len2;

void initial()
{
    C[make_pair('A', 'A')] = 5;
    C[make_pair('C', 'C')] = 5;
    C[make_pair('G', 'G')] = 5;
    C[make_pair('T', 'T')] = 5;
    C[make_pair('A', 'C')] = C[make_pair('C', 'A')] = -1;
    C[make_pair('G', 'A')] = C[make_pair('A', 'G')] = -2;
    C[make_pair('A', 'T')] = C[make_pair('T', 'A')] = -1;
    C[make_pair('A', '-')] = C[make_pair('-', 'A')] = -3;
    C[make_pair('C', 'G')] = C[make_pair('G', 'C')] = -3;
    C[make_pair('C', 'T')] = C[make_pair('T', 'C')] = -2;
    C[make_pair('C', '-')] = C[make_pair('-', 'C')] = -4;
    C[make_pair('G', 'T')] = C[make_pair('T', 'G')] = -2;
    C[make_pair('G', '-')] = C[make_pair('-', 'G')] = -2;
    C[make_pair('T', '-')] = C[make_pair('-', 'T')] = -1;
    return;
}

int dfs(int x, int y)
{
    if(x == len1 && y == len2) return 0;
    if(dp[x][y] != -inf) return dp[x][y];
    if(x + 1 <= len1)
    dp[x][y] = max(dp[x][y], dfs(x + 1, y) + C[make_pair(s1[x], '-')]);
    if(y + 1 <= len2)
    dp[x][y] = max(dp[x][y], dfs(x, y + 1) + C[make_pair('-', s2[y])]);
    if(x + 1 <= len1 && y + 1 <= len2)
    dp[x][y] = max(dp[x][y] , dfs(x + 1, y + 1) + C[make_pair(s1[x], s2[y])]);
    return dp[x][y];
}

int main()
{
    initial();
    int t;
    scanf("%d", &t);
    while(t--)
    {
        for(int i = 0; i <= 100; i++)
        {
            for(int j = 0; j <= 100; j++)
            {
                dp[i][j] = - inf;
            }
        }
        scanf("%d", &len1);
        getchar();
        for(int i = 0; i < len1; i++)
        {
            scanf("%c", s1 + i);
        }
        scanf("%d", &len2);
        getchar();
        for(int i = 0; i < len2; i++)
        {
            scanf("%c", s2 + i);
        }
        printf("%d\n", dfs(0, 0));
    }
    return 0;
}