二、ChIA-PET2——1、安装依赖的环境

一、安装ChIA-PET2:

1、下载ChIA-PET2:

https://github.com/GuipengLi/ChIA-PET2

2、安装

tar -zxvf ChIA-PET2-0.9.3.tar.gz
cd /home/fengyongxian/shm/tartar/ChIA-PET2/ChIA-PET2-0.9.3
chmod +x bin/ChIA-PET2
make

二、安装依赖环境

1、安装zlib

[fengyongxian@node01 ~]$ cd /home/fengyongxian/shm/tartar/zlib
[fengyongxian@node01 zlib]$ tar -zxvf zlib-1.2.11.tar.gz
[fengyongxian@node01 zlib]$ cd /home/fengyongxian/shm/tartar/zlib/zlib-1.2.11
[fengyongxian@node01 zlib-1.2.11]$ ./configure
[fengyongxian@node01 zlib-1.2.11]$ make
[fengyongxian@node01 zlib-1.2.11]$ make clean

2、安装Samtools

autoheader            # Build config.h.in (this may generate a warning about
                      # AC_CONFIG_SUBDIRS - please ignore it).
autoconf -Wno-syntax  # Generate the configure script
./configure           # Needed for choosing optional functionality
make
make install

3、安装gcc

yum install gcc
[root@node01 ~]# yum install gcc
已加载插件:fastestmirror, langpacks
amdgpu-pro-local                                                                    | 2.9 kB  00:00:00     
base                                                                                | 3.6 kB  00:00:00     
epel/x86_64/metalink                                                                | 9.3 kB  00:00:00     
epel                                                                                | 4.7 kB  00:00:00     
extras                                                                              | 2.9 kB  00:00:00     
updates                                                                             | 2.9 kB  00:00:00     
(1/2): epel/x86_64/updateinfo                                                       | 1.0 MB  00:00:00     
(2/2): epel/x86_64/primary_db                                                       | 6.9 MB  00:00:00     
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * base: mirrors.bfsu.edu.cn
 * epel: mirro
  • 0
    点赞
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值