使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位

于 2022-10-18 18:06:44 发布
阅读量584 收藏 1
点赞数
文章标签： 支持向量机 算法 机器学习
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/wcrayon/article/details/127393717
版权
该博客探讨如何使用蛋白质和mRNA序列信息来预测蛋白质亚线粒体定位，重点介绍了M254数据集、特征选择（如3-mer、AAC、PSSM、GO信息）以及支持向量机作为预测方法。通过特征工程和优化，预测准确率得到了显著提升。
摘要由CSDN通过智能技术生成

使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位

对亚线粒体蛋白质Ｍ254的预测
数据集

Ｍ254（来自M317）

共包含317条亚线粒体蛋白质且序列间的相似性低于40％，分别位于基质、内膜、外膜三个位置。从ＧｅｎｅＢａｎｋ中找出每条蛋白质对应的成熟的ｍＲＮＡ，即编码蛋白质的ｍＲＮＡ。由于有的蛋白质在数据库中没有实验证实的ｍＲＮＡ，并且删除亚细胞位置从单定位变成多定位的、在Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ数据库中已经删除的蛋白质，获得254条与ｍＲＮＡ对应的蛋白质，即Ｍ254。

在这里插入图片描述

特征选择

  1. mRNA序列的Ｈ联体频数（３-ｍｅｒ）

  2. 分段氨基酸组分（ＡＡＣ）

    将序列分段整理为相同长度的序

最低0.47元/天 解锁文章
阿头！
关注
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值