文献解读|利用Biolog EcoPlates 和PICRUSt2分析后期虾池细菌群落功能多样性

最新推荐文章于 2023-09-14 08:44:03 发布

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文章标签：数据挖掘人工智能数据分析

本文链接：https://blog.csdn.net/weifanbio/article/details/124755279

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该研究结合Biolog EcoPlates和PICRUSt2技术，分析南美白对虾养殖池后期的细菌群落功能多样性。结果表明，养殖池沉积物的微生物遗传和功能多样性高于水样，且不同碳源的利用与特定细菌门存在相关性。这一发现有助于理解虾塘微生物群落结构与功能的关系，为水质管理和益生菌应用提供依据。

摘要由CSDN通过智能技术生成

TITLE:Analysis of bacterial community functional diversity in late-stage shrimp (Litopenaeus vannamei) ponds using Biolog EcoPlates and PICRUSt2
译名：利用 Biolog EcoPlates 和 PICRUSt2 分析后期虾（凡纳滨对虾）池细菌群落功能多样性
期刊：Aquaculture
日期：2022年8月
下载链接：
https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2021.737288

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文献亮点

1.本研究首次将Biolog EcoPlates与高通量测序技术相结合；研究南美白对虾池塘养殖后期微生物群落的实际代谢特征和预测功能，并讨论了它们之间的相关性。
2.尽管正在进行越来越多的研究，但对微生物群落的实际代谢功能与预测功能之间的关系知之甚少；本结果表明南美白对虾池塘养殖后期微生物群落的实际代谢特征与预测功能之间存在显着相关性。

文献简介

本研究利用高通量测序技术和群落水平生理分析 (CLPP) 方法研究后期三个密集的南美白对虾养殖池的水样和沉积物中发现的细菌群落的结构和功能多样性。评估了使用 PICRUSt2 的假定函数与通过 Biolog EcoPlates 的实际代谢谱之间的相关性。结果表明，养殖池塘沉积物中微生物群落的遗传和功能多样性显着高于水样。

在水样中，微生物群落利用的最主要碳源包括羧酸（35.08%）、聚合物（24.91%&#x