matlab和r语言做热图,手把手教你用 R 绘制聚类热图（含代码和注释）

大家好，有朋友在后台问如何用 R 绘制聚类热图，其实绘制聚类图的方法有很多，比如 MeV 软件等等，我们今天看如何用 R 来绘制聚类图。

首先我们看原始数据，原始数据有两组，每组 4 个样品，共八个样品，每个样品有 35 个 microRNA，目的是对 35 个 microRNA 和 8 个样品进行聚类。

将目标文件所在目录通过 setwd 命令设置为当前工作目录，并用 getwd() 查看目录是否设置成功；设置成功后，利用 read.table 命令读入目标文件(heatmap_example.txt，注意将文件保存为 tab 分隔的纯文件文件 txt)，将第一行的样本名设置为列名(header = T)，将第一列设置为行名(row.names = 1)，通过 head(data) 查看文件前 6 行。

###安装软件包

install.packages("pheatmap")

install.packages("vegan")

###加载所需软件包

library(pheatmap)