如何利用计算机模拟分子生物学,分子生物学软件教学的经验浅谈.doc

分子生物学软件教学的经验浅谈

分子生物学软件教学的经验浅谈

摘要：分子生物学是生命科学和生物技术的基础学科，其教学尤其是实验教学得到了各个高等院校的普遍重视，但是对于应用性强的分子生物学软件的教学却长期以来受到忽视。笔者首次在厦门大学的夏季短学期中开设《分子生物学常用软件的应用》课程已有五余年，本文总结了分子生物学软件教学的经验，提出教学改进的建议，阐述了软件应用与实验设计的必要联系，为生物医学类学科的软件教学提供参考，为进一步提高软件教学质量和实施软件教学改革奠定基础。

关键词：分子生物学；软件教学；创新性思维

中图分类号：Q7-4 文献标识码：A文章编号：1007-9599 (2011) 09-0000-02

The Teaching Experience of Molecular Biology Software

Li Shaowei

(School of Life Sciences,Xiamen University,National Diagnostics Infectious Diseases and Vaccine Research Center,Xiamen361005,China)

Abstract:Molecular biology and biotechnology,life science based subjects,especially the experiment of teaching in all institutions of higher education has been widespread attention,but for the application of strong molecular biology software,teaching has long been neglected.I first summer in the short term Xiamen University in the creation of"common software applications of molecular biology"course has been five years,this article summarizes the molecular biology software,teaching experience,teaching suggestions for improvement put forward to explain the software applications and experimental design of the necessary links for the biomedical disciplines,software,teaching classes to provide a reference for the software to further improve the quality of teaching and teaching reform lay the foundation for the implementation of the software.

Keywords:Molecular biology;Software teaching;Innovative thinking

目前，许多生命科学的研究已经深入到了分子水平，分子生物学已经渗透到了各个研究领域中：从微观的细胞生物学到宏观的生态学，从理论计算为主的生物信息学到解析分子机制的结构生物学，从药物筛选和改造到基因工程疫苗研制。分子生物学的研究从生命的遗传物质DNA的信息开始，探索生命现象的内在本质，形成了生物信息，进而利用这些信息改造生命，基因工程技术就是分子生物学实践的最重要体现[1]。而分子生物学的实验设计和基因信息资源的利用需由计算机软件辅助进行，因此，软件教学是学生更好地理解分子生物学理论和掌握基因工程技术的重要途径。笔者2005年始在厦门大学夏季的短学期课程中开设《分子生物学常用软件的应用》课程，以下浅谈教学过程中获得的体会和经验，并提出些教学改进的建议，可供其他理学学科的软件教学参考。

一、分子生物学实验软件教学的内容

分子生物学常用软件的教学任务是培养一批能够把生命科学与计算机科学有机相结合的科研人才，他们将能够迅速适应分子生物学、生物化学、生物信息学和结构生物学等领域的研究工作。教学的目的是介绍分子生物学软件涉及的相关理论知识，结合具体的实务应用，引导学生利用互联网资源进行分子生物学软件的学习，从而让学生掌握重组克隆子构建的设计、PCR引物设计、序列特征和蛋白质性质与基因表达的关系，以及了解基本的生物信