高斯09linux教程,Gaussian 09的安装与使用

Gaussian 09的安装与使用

一、Gaussian 09的安装

以linux为例子，假设使用光盘安装、bash环境下安装、命令行提示符为”>”。

假设安装目录为”dir”, 光盘的目录为/media/cdrom, 计划使用g09的用户组为g09

>export g09root=”dir”

>export mntpnt=/media/cdrom

>cd $g09root

>tar -zvxf $mntpnt/tar/*.tgz

>chgrp -R grp g09

>cd g09

>./bsd/install

二、Gaussian 09的使用

假设g09安装目录为“dir”， G09的Scrath files目录为“sdir”

>export g09root=”dir”

>export GAUSS_SCRDIR=”sdir”

或者将上述两行命令加入到文件$g09root/g09/bsd/g09.profile

每次运行G09前先运行：

>source $g09root/g09/bsd/g09.profile

三、运行一个实例

假设该作业名称为test429.com，结果为test429.log

>$g09root/g09/g09 < test429.com > test429.log

＊Linda版并行的Gaussian09与普通版Gaussian(共享内存并行)版的安装没有区别。只是在通过HPC计算时因为作业管理系统的原因，在使用上要注意：作业管理系统(比如PBS，LSF，SGE)先获得计算资源，通过内置的变量获得节点名称传递给Gaussian就可以了；而单机共享内存并行不需要考虑节点名称。比如PBS类的作业管理系统，”$PBS_NODEFILE”给出当前作业”$PBS_JOBID”的节点名称，将节点名称赋值给变量GAUSS_WDEF就可以实现跨节点并行。

参考资料

四、快速入门教程

五、寻求技术支持