r 语言roc_R语言画ROC曲线总结-CSDN博客

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_29414105/article/details/113996388

本文探讨了如何使用R语言在CRAN中查找和比较ROC曲线绘图包，如ROCR、pROC、PRROC等。通过分析下载量和功能，展示了这些包如何帮助数据科学家进行二元分类评估，并提供了各包绘制ROC曲线的实例。

摘要由CSDN通过智能技术生成

在本文中，我描述了如何在CRAN中搜索用于绘制ROC曲线的包，并重点介绍了六个有用的包。

尽管我从一些我想谈论的软件包开始就有了一些想法，例如ROCR和pROC(我在过去发现它们很有用)，但我还是决定使用相对较新的软件包pkgsearch来搜索CRAN并查看其中的内容。该package_search()函数将文本字符串作为输入，并使用基本的文本挖掘技术来搜索所有CRAN。

library(tidyverse) # for data manipulation library(dlstats) # for package download stats library(pkgsearch) # for searching packages

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经过一番尝试和错误之后，我确定了以下查询，其中包括许多与ROC相关的有趣软件包。

rocPkg

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rocPkgShort % filter(maintainer_name != "ORPHANED", score > 190) %>% select(score, package, downloads_last_month) %>% arrange(desc(downloads_last_month)) head(rocPkgShort)

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## # A tibble: 6 x 3 ## score package downloads_last_month ## ## 1 690. ROCR 56356 ## 2 7938. pROC 39584 ## 3 1328. PRROC 9058 ## 4 833. sROC 4236 ## 5 266. hmeasure 1946 ## 6 1021. plotROC 1672

为了完成选择过程，我做了艰苦的工作，浏览软件包的文档，以挑选出我认为通常对大多数数据科学家有用的内容。下图使用了Guangchuang Yu的dlstats软件包，查看我选择分析的六个软件包的下载历史记录。

library(dlstats) shortList

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9a7e50070931

2005年

以下代码ROCR使用包装随附的综合数据集设置并绘制默认的ROC曲线。在整个文章中，我将使用相同的数据集。

library(ROCR) ## Loading required package: gplots ## ## Attaching package: 'gplots' ## The following object is masked from 'package:stats': ## ## lowess # plot a ROC curve for a single prediction run # and color the curve according to cutoff. data(ROCR.simple) df

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## Loading required package: gplots

## ## Attaching package: 'gplots'

## The following object is masked from 'package:stats': ## ## lowess

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9a7e50070931

2010

pROC也受到数据科学家的欢迎。我喜欢AUC在图中绘制曲线下面积的置信区间非常容易。

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9a7e50070931

2014年

该roc.curve()函数会绘制出干净整齐的ROC曲线。