我试图在Python中进行不完全的Cholesky分解,但找不到直接的Python包。在
因为我能在网上找到的大多数可用代码都是用Matlab编写的,所以我想绕道过去将matlab代码编译到一个共享库(我使用macos和matlab_2014a,因此它应该生成.dylib文件)
使用Ctypes在Python中加载库
下面列出了详细的步骤:
0。下载Matlab源代码
代码可以从F.Bach的网页link to zip file下载,该网页包含以下文件:panc:csi-1.0 panc25$ ls
center.m csi.dll csi.mexglx csi_gaussian.dll csi_gaussian.mexglx readme.txt
csi.c csi.m csi_gaussian.c csi_gaussian.m demo_csi.m sqdist.m
1。将matlab代码编译成共享库
然后按照this post运行命令:
^{pr2}$
大约一分钟后,终端打印MEX completed successfully,在我的文件夹中有panc:csi-1.0 panc25$ ls
center.m csi.m csi_gaussian.dll demo_csi.m libcsi.exports readme.txt
csi.c csi.mexglx csi_gaussian.m libcsi.cpp libcsi.h sqdist.m
csi.dll csi_gaussian.c csi_gaussian.mexglx libcsi.dylib mccExcludedFiles.log
其中libcsi.dylib是我想要的共享库。在
2。在Python中加载库
然后我打开IPython并尝试加载库:In [1]: import ctypes
In [2]: ctypes.C
ctypes.CDLL ctypes.CFUNCTYPE
In [2]: ctypes.CDLL('libcsi.dylib')
---------------------------------------------------------------------------
OSError Traceback (most recent call last)
in ()
----> 1 ctypes.CDLL('libcsi.dylib')
/Users/panc25/anaconda/lib/python2.7/ctypes/__init__.pyc in __init__(self, name, mode, handle, use_errno, use_last_error)
363
364 if handle is None:
--> 365 self._handle = _dlopen(self._name, mode)
366 else:
367 self._handle = handle
OSError: dlopen(libcsi.dylib, 6): Library not loaded: @rpath/libmwmclmcrrt.8.3.dylib
Referenced from: /Users/panc25/Downloads/csi-1.0/libcsi.dylib
Reason: image not found
即使我用完整路径替换ctypes.CDLL('libcsi.dylib')中的文件名,这个问题仍然存在。在
所以我很困惑。共享库在那里,但是为什么Python说“找不到图像”?
顺便说一句
由于源代码也通过mex.h提供C实现,所以我还尝试先创建一个.mex文件,然后将{}编译到共享库中,如下所示:panc:csi-1.0 panc25$ mex csi.c
它创建了csi.mexmaci64文件。然后根据this link,我打电话给:panc:csi-1.0 panc25$ mcc -B csharedlib:csi2 csi.mexmaci64
生成了csi2.dylib文件。在
但是当我试图用Python加载它时,我遇到了同样的错误。在
有谁能告诉我出什么事了吗?