linux二进制包指定路径,关于linux：将samtools二进制文件复制到某些目录的位置

我正在Mac OS X上安装袖扣，这是说明：

http://cufflinks.cbcb.umd.edu/tutorial.html

在"安装SAM工具"下，按照以下说明进行操作

下载SAM工具

将SAM工具压缩包和cd解压缩到SAM工具源目录。

通过在命令行中输入make来构建SAM工具。

选择一个目录，要将SAM工具二进制文件，随附的库libbam.a和库标头复制到该目录中。常见的选择是/ usr / local /。

将libbam.a复制到上面选择的文件夹中的lib /目录中(例如/ usr / local / lib /)

在include /目录中创建一个名为" bam"的目录(例如/ usr / local / include / bam)

将标头(以.h结尾的文件)复制到您在上面创建的include / bam目录中(例如/ usr / local / include / bam)

将samtools二进制文件复制到PATH中的某个目录。

我已经完成了7个步骤，但是我不确定如何继续执行最后一个步骤(＃8)：我应该使用以下命令：

sudo cp -a samtools-0.1.18 /usr/local/

或进入其他目录？步骤8中的PATH指示什么？谢谢！

为了回答您的问题，我将介绍一些基本的Linux知识，这些知识帮助我了解了二进制文件及其位置。

在Linux中，您可以通过输入二进制文件的完整路径来运行二进制文件，然后二进制文件将运行。例如，如果我在/usr/local/bin中有一个名为foo的二进制文件，则将运行命令/usr/local/bin/foo，并且将运行foo二进制文件。

PATH的目的是提供快捷方式，因此您无需键入二进制文件的完整路径，只需键入二进制文件的名称即可。 PATH是一个变量，包含所有具有要应用快捷方式的二进制文件的目录。因此，参考前面的示例，如果/usr/local/bin在我的PATH变量中，则可以只运行foo。

因此，要回答您的问题，您可以通过运行命令echo $PATH来确定PATH中的目录，并且如果其中一个目录是samtools二进制文件所在的目录，那就太好了！如果没有，您可以将samtools二进制文件移动到这些目录之一，这样就不必每次运行二进制文件时都放置完整路径。